不一樣的疾病,一樣的遺傳變異
日期:2016-05-18 09:25:40
在分析基因與性狀之間的關(guān)聯(lián)時(shí),人們往往采用全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)。不過(guò),紐約基因組中心和23andMe的研究人員似乎并不滿足于GWAS分析。他們收集了大規(guī)模研究中研究過(guò)的所有性狀,想看看這些看似無(wú)關(guān)的性狀之間是否存在關(guān)聯(lián)。他們果然有收獲,還發(fā)表在《Nature Genetics》上。
“盡管基因組學(xué)研究已經(jīng)成功鑒定了影響疾病風(fēng)險(xiǎn)的遺傳變異,但了解遺傳變異在許多疾病中的影響也是很重要的,”文章的第一作者,紐約基因組中心的Joseph Pickrell談道。
Pickrell及其同事收集了43項(xiàng)大規(guī)模GWAS研究的數(shù)據(jù),它們主要關(guān)注42種不同的表型,從遺傳病風(fēng)險(xiǎn)到體質(zhì)特征、代謝表型和血液相關(guān)性狀。這其中包括17個(gè)由23andMe開(kāi)展的未發(fā)表GWAS。
在利用一種統(tǒng)計(jì)方法來(lái)掃描與多個(gè)人類表型相關(guān)的變異時(shí),研究人員檢測(cè)到341個(gè)基因組位點(diǎn),它們似乎影響了至少兩種性狀。
研究小組還發(fā)現(xiàn)了個(gè)別變異似乎與幾種不同的表型存在關(guān)聯(lián)。例如,他們?cè)诰幋a鋅轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白的SLC39A8基因中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)非同義SNP,它與七種不同的人體狀況相關(guān),從精神分裂癥和帕金森氏癥的風(fēng)險(xiǎn)到身高。同樣,ABO血型基因附近的一個(gè)變異與11種表型相關(guān),包括冠狀動(dòng)脈疾病、血液性狀、脂質(zhì)特征,以及接受扁桃體切除術(shù)的風(fēng)險(xiǎn)。
研究人員也描述了特定性狀,它們似乎與共同的遺傳變異相關(guān)。例如,他們意外發(fā)現(xiàn),炎性腸病相關(guān)的變異與精神分裂癥風(fēng)險(xiǎn)變異重疊。在一組與青春期和生長(zhǎng)特征相關(guān)聯(lián)的變異中,研究人員發(fā)現(xiàn),與月經(jīng)年齡相關(guān)的SNP似乎對(duì)身高及其他性狀有著下游影響。
研究結(jié)果還概括了一些有著共同特征的疾病,如哮喘、類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、克羅恩氏病及其他自身免疫疾病?,F(xiàn)有的數(shù)據(jù)也讓人們開(kāi)始梳理一些身體狀況之間的因果關(guān)系,比如一些變異,在體重增加之后調(diào)節(jié)甘油三酯水平升高。
研究人員預(yù)測(cè),各種人類表型的遺傳關(guān)聯(lián)模式可能更容易破譯,特別是越來(lái)越多的個(gè)體經(jīng)過(guò)廣泛的基因分型。他們指出,目前還不清楚,罕見(jiàn)病相關(guān)的變異是否也存在重疊。