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Nature子刊發(fā)布突破性單細(xì)胞標(biāo)記技術(shù)

日期:2016-05-27 08:53:54

 加拿大蒙特利爾大學(xué)和麥吉爾大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)在Nature Communications雜志上發(fā)布了一種強(qiáng)大的單細(xì)胞標(biāo)記技術(shù)。這種光漂白細(xì)胞標(biāo)記法(CLaP)將成為研究者們的寶貴工具,廣泛用于各個(gè)領(lǐng)域的科學(xué)研究,特別是基因組學(xué)研究。

 

“我們把激光當(dāng)作畫筆,一個(gè)一個(gè)地標(biāo)記細(xì)胞,”蒙特利爾大學(xué)副教授Santiago Costantino說。“過去,標(biāo)記特定細(xì)胞需要事先知道它的分子信息,否則只能通過非特異性方法標(biāo)記一大群細(xì)胞。我們開發(fā)的新技術(shù)僅僅根據(jù)觀測信息來涂色,比如只標(biāo)記體形大的細(xì)胞、速度快的細(xì)胞或者瘦長的細(xì)胞。隨后,人們可以在分子水平上研究了這些細(xì)胞的特殊之處。這種標(biāo)記技術(shù)能夠在數(shù)百萬正常細(xì)胞中找到罕見的特殊細(xì)胞。”

 

CLaP使用起來非常簡單,成本也不高,適合標(biāo)準(zhǔn)共聚焦顯微鏡。CLaP能夠通過自動化實(shí)現(xiàn)高通量標(biāo)記,并且對細(xì)胞沒有任何損傷。這種用途廣泛的非侵入性高效標(biāo)記法,將大大推動新一代測序在單細(xì)胞基因組領(lǐng)域的應(yīng)用。

 

近年來蓬勃發(fā)展的單細(xì)胞基因組學(xué)研究改變了人們對許多疾病的認(rèn)識。越來越多的研究表明,隱藏在數(shù)百萬細(xì)胞中的罕見細(xì)胞會起到重要的作用。“我們開發(fā)的技術(shù)可以幫助人們挑出這些細(xì)胞,進(jìn)行一系列過去無法實(shí)現(xiàn)的試驗(yàn),”麥吉爾大學(xué)助理教授Dr. Claudia Kleinman說。

 

多細(xì)胞生物的每個(gè)細(xì)胞都攜帶著相同的遺傳學(xué)信息。但科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),每一個(gè)細(xì)胞都是獨(dú)一無二的。不同類型的細(xì)胞激活特定的基因組合,即使是同類細(xì)胞,基因表達(dá)也會出現(xiàn)差異。The Scientist雜志最近聯(lián)系了單細(xì)胞研究領(lǐng)域的一些專家,請他們分享了在單細(xì)胞中進(jìn)行轉(zhuǎn)錄研究的秘訣。希望幫助研究者們更好地構(gòu)建文庫,處理和分析結(jié)果數(shù)據(jù)。

 

單細(xì)胞基因組旨在通過組學(xué)方法研究單個(gè)細(xì)胞。近年來隨著技術(shù)的發(fā)展,這一年輕的領(lǐng)域正在迅速成熟起來。單細(xì)胞基因組研究的前身可以追溯到用芯片檢測單細(xì)胞的基因表達(dá)。不過,新一代DNA測序才是單細(xì)胞基因組學(xué)的大功臣,這些技術(shù)的出現(xiàn)讓單細(xì)胞基因組研究最終一飛沖天。

 

統(tǒng)計(jì)和計(jì)算方法是單細(xì)胞基因組研究的核心,只有正確的方法才能幫助我們從數(shù)據(jù)中提取有意義的生物學(xué)信息。前不久,德克薩斯大學(xué)MD安德森癌癥中心的研究人員開發(fā)了首個(gè)用于單細(xì)胞DNA測序的突變檢出程序——Monovar,這一重要研究成果發(fā)表在Nature Methods雜志上。研究人員認(rèn)為Monovar是單細(xì)胞測序評估SNV的一大進(jìn)步,能夠?yàn)槿藗兲峁┒喾N疾病的關(guān)鍵信息。

 

特別關(guān)注