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中美科學(xué)家用CRISPR制備腎癌模型

日期:2016-07-07 09:27:33

 轉(zhuǎn)移性腎細(xì)胞癌(mRCC)幾乎是無(wú)法治愈的,是RCC有關(guān)的高死亡率的主要原因。Von Hippel Lindau (VHL)是一個(gè)腫瘤抑制基因,在大多數(shù)的透明細(xì)胞RCCccRCC)病例中是缺失的。然而,它對(duì)于缺氧誘導(dǎo)因子-1α(HIF-1α) -2α (HIF-2α)的調(diào)控發(fā)揮了什么作用,還沒(méi)有得到很好的研究。

 

630日,Nature子刊《Scientific Reports》在線刊登了加州大學(xué)洛杉磯分校、華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院的一項(xiàng)最新研究成果,題為“CRISPR-Mediated VHL Knockout Generates an Improved Model for Metastatic Renal Cell Carcinoma”。這項(xiàng)研究的通訊作者是加州大學(xué)洛杉磯分校的華裔教授吳若萍(Lily Wu)。華中科技大學(xué)同濟(jì)醫(yī)學(xué)院的Hua XuWei Guan等人是本文共同作者。

 

mRCC的治療方案是有限的,因?yàn)檫@種腫瘤對(duì)傳統(tǒng)化療和放療表現(xiàn)出耐藥性。治愈這種疾病的一種療法是白介素-2IL-2)療法,但是只作用于大約7%的患者。最近發(fā)展起來(lái)的靶向療法——包括靶定免疫檢查點(diǎn)抑制劑程序性細(xì)胞死亡-1PD-1)的療法,表現(xiàn)出一定的功效。但是,還缺乏持久的干預(yù)措施來(lái)對(duì)抗mRCC,從而迫切需要一種疾病模型,并深入了解這種疾病的驅(qū)動(dòng)機(jī)制。

 

我們對(duì)于ccRCC的了解來(lái)自于對(duì)腫瘤抑制基因VHL的研究。遺傳性的VHL綜合征病例表現(xiàn)出ccRCC的發(fā)展風(fēng)險(xiǎn)升高。隨后的研究表明,這個(gè)基因在高達(dá)90%的散發(fā)性ccRCC病例中是沉默的。VHL通過(guò)識(shí)別和靶定缺氧誘導(dǎo)因子(HIF-1α, HIF-2α和HIF-3α)的α亞基用于泛素化和降解,而調(diào)控著缺氧反應(yīng)。在低氧條件下,VHL不能識(shí)別HIF-αs,它們通過(guò)與HIF-1β結(jié)合來(lái)易位到細(xì)胞核中,并制定缺氧反應(yīng)所必需的轉(zhuǎn)錄程序。

 

研究人員試圖通過(guò)敲除VHL,來(lái)制備ccRCC的小鼠模型。最近的研究表明,除了VHL之外,Bap1的缺失可有助于更一致地制備ccRCC小鼠模型。雖然其中一些研究顯示出早期囊性ccRCC變化和局部腫瘤的跡象,但是這些研究無(wú)法產(chǎn)生這種疾病的侵襲性、轉(zhuǎn)移性形式。為此,許多研究都依賴于RENCA模型,最廣泛使用的RCC免疫活性小鼠模型。盡管這種小鼠模型的效用已經(jīng)得以證明,但是科學(xué)家們最擔(dān)心的問(wèn)題是,其在野生型VHL表達(dá)中的臨床適用性。

 

以前的研究表明,VHL缺失可促進(jìn)一種更具侵襲性和轉(zhuǎn)移性的腫瘤模型。有大量研究表明,靶定VHL功能可能導(dǎo)致一小部分的上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)。這個(gè)過(guò)程已被確定為一個(gè)中心節(jié)點(diǎn),腫瘤通過(guò)這個(gè)過(guò)程從它們的原發(fā)部位轉(zhuǎn)移到身體其他部位。EMT涉及到細(xì)胞間接觸的減少,以及從上皮細(xì)胞基底膜上脫離,轉(zhuǎn)化為一種更為移動(dòng)性和侵襲性的細(xì)胞類型。這些表型變化的同時(shí),是各種各種的分子變化,包括上皮標(biāo)記的缺失,例如在臨床ccRCC標(biāo)本中常見(jiàn)的E鈣粘素,還有一些間葉細(xì)胞標(biāo)記的獲得,例如N鈣黏著蛋白和α-SMA。值得注意的是,許多研究證明了HIF-1α對(duì)于推動(dòng)這些變化的作用。此外,HIF-1α已被證明可在其他腫瘤轉(zhuǎn)移模型中導(dǎo)致轉(zhuǎn)移。這些結(jié)果表明,在RENCA 模型中刪除VHL,可能會(huì)產(chǎn)生一種更具轉(zhuǎn)移性的臨床相關(guān)模型。

 

CRISPR基因操縱方法最近已被用于常規(guī)實(shí)驗(yàn)室研究。這一突破性的基因敲除技術(shù),因?yàn)橐子眯院屯耆贸蚬δ艿挠行远??;卺勀撴溓蚓m應(yīng)性免疫系統(tǒng),這種以RNA為基礎(chǔ)的基因組編輯技術(shù),已迅速在許多生物研究中證實(shí)了其效用。研究人員開(kāi)發(fā)出CRISPR方法,是為了生成基因敲除小鼠,在細(xì)胞系中進(jìn)行全基因組篩查,在小鼠體內(nèi)敲除基因,并在體內(nèi)篩查轉(zhuǎn)移性的基因。然而,迄今為止,很少有研究證明CRISPR介導(dǎo)的小鼠細(xì)胞系修改,來(lái)生成改進(jìn)的可移植小鼠腫瘤模型。

 

在這項(xiàng)研究中,研究人員利用CRISPR基因組編輯工具,敲除RENCA細(xì)胞中的VHL表達(dá)。他們發(fā)現(xiàn),在RENCA模型中,CRISPR / Cas9介導(dǎo)的VHL敲除,可導(dǎo)致指示EMT的形態(tài)學(xué)和分子改變,進(jìn)而驅(qū)動(dòng)到肺部的轉(zhuǎn)移增加。HIF-1α缺陷型的RENCA細(xì)胞,在VHL敲除后不能發(fā)生EMT。

 

RNA-seq顯示,幾個(gè)HIF-1α調(diào)控的基因,在VHL基因敲除的細(xì)胞中是上調(diào)的,它們的過(guò)度表達(dá)意味著,癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)中一種更具侵襲性的ccRCC。在一個(gè)新的臨床數(shù)據(jù)集中的獨(dú)立驗(yàn)證證實(shí),相對(duì)于鄰近的正常組織,這些基因在ccRCC樣本中是上調(diào)的。這些結(jié)果表明,VHL的缺失可能通過(guò)穩(wěn)定RCC中的HIF-1α而驅(qū)動(dòng)腫瘤細(xì)胞的傳播。更好的理解這個(gè)現(xiàn)象背后的機(jī)制,可以指導(dǎo)科學(xué)家們尋找更有效的療法對(duì)抗mRCC。

 

科學(xué)家們對(duì)腎癌這種疾病進(jìn)行了深入的研究。20148月,貝勒醫(yī)學(xué)院帶領(lǐng)的一個(gè)國(guó)際科學(xué)合作項(xiàng)目,發(fā)現(xiàn)了可能導(dǎo)致腎嫌色細(xì)胞癌的遺傳學(xué)改變的線索,不僅為這種罕見(jiàn)癌癥,也為其他類型癌癥,提供了新的見(jiàn)解。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在2014821日的國(guó)際著名期刊《Cancer Cell》。相關(guān)閱讀:測(cè)序揭示罕見(jiàn)腎癌的獨(dú)特遺傳變化。

 

201512月,Cell雜志的“SnapShot: Renal Cell Carcinoma”這篇文章總結(jié)了目前關(guān)于這種癌癥基因全景圖中的幾個(gè)關(guān)鍵特征,主要途徑,腫瘤演變和異質(zhì)性等多方面內(nèi)容,并且也介紹了腎細(xì)胞癌的相關(guān)治療進(jìn)展。

 

今年3月份,貝勒醫(yī)學(xué)院的一個(gè)研究團(tuán)隊(duì)深入分析了近900個(gè)腎癌樣本。過(guò)去人們根據(jù)腎癌細(xì)胞在顯微鏡下的特征將腎癌分為三個(gè)大類。而這項(xiàng)研究表明,在分子水平上腎癌還可以進(jìn)一步分為九個(gè)亞類。這些腎癌亞類各具特征,受到影響的分子通路和患者的生存情況也大相徑庭。