吉林大學用CRISPR解析致癌miRNA
日期:2016-08-10 09:03:25
正常印跡的胰島素樣生長因子-II(IGF2)基因,在多種人類惡性腫瘤中是異常表達的,但這種異常調(diào)節(jié)背后的機制仍然不清楚。最近,來自吉林大學附屬第一醫(yī)院和斯坦福大學醫(yī)學院的研究人員,在國際著名學術期刊《Oncotarget》發(fā)表題為“CRISPR Cas9-guided chromatin immunoprecipitation identifies miR483 as an epigenetic modulator of IGF2 imprinting in tumors”的學術成果。這項研究利用CRISPR Cas9介導的染色質(zhì)免疫沉淀法,確定了miR483在IGF基因表達調(diào)控中起的一個新作用。吉林大學附屬第一醫(yī)院腫瘤中心的胡繼繁教授和李薇教授、以及斯坦福大學醫(yī)學院的Andrew R. Hoffman,是本文共同通訊作者。
胰島素樣生長因子II(IGF-II),是一種可促進生長和代謝作用的胎兒分裂素,在多種人類惡性腫瘤中是異常調(diào)節(jié)的。通過結合1型胰島素樣生長因子受體(IGF1R),IGF-II可通過自分泌、旁分泌和內(nèi)分泌的途徑,促進腫瘤生長。通過刺激MAPK和/或PI3-K/Akt信號通路,IGF-II可引起細胞凋亡減少,增加細胞增殖和耐藥性。因此,IGF1R已經(jīng)被研究作發(fā)展為腫瘤特異性基因治療的一個靶標。
IGF-II的編碼基因IGF2是一個母系印跡基因,位于染色體11p15。在出生后,四個啟動子調(diào)節(jié)著IGF2基因的表達;啟動子P1指導著雙等位基因的表達,而啟動子P2-P4在大多數(shù)組織中(除了腦)刺激IGF2的單等位基因表達。位于染色體11p15.5上的IGF2和H19之間的印記控制區(qū)(ICR)中的等位基因特異性表觀遺傳修飾,調(diào)控著單等位基因的表達。IGF2印跡缺失(LOI)與IGF2的雙等位基因表達,是人類多種腫瘤與腫瘤干細胞的標志,尤其是兒童腫瘤。LOI已知可引起細胞增殖加快,并增加IGF1R信號通路的敏感性。
但是,關于“在具有IGF2 LOI的腫瘤中,正常抑制的母系IGF2等位基因激活的根本分子機制”,我們?nèi)匀恢跎佟jP于“在ICR中的表觀遺傳修飾”的報道也是不一致的,IGF2啟動子區(qū)中的表觀遺傳學調(diào)節(jié)因子,一直都沒有得以廣泛的研究。
因此,該研究小組決定找出調(diào)節(jié)IGF2基因表達的IGF2啟動子中的分子組件。CRISPR-Cas9系統(tǒng)已被用于特定基因的基因組編輯。當與轉錄抑制因子或增強子融合時,gRNA引導的酶可以用于調(diào)節(jié)基因啟動子的活性。研究人員利用最近其實驗室開發(fā)的CRISPR Cas9引導染色質(zhì)免疫共沉淀(CasIP)(未發(fā)表),來釣取IGF2啟動子復合物,并將miR483確定為一個分子,可與IGF2啟動子相互作用,并參與IGF2印跡的調(diào)控。
在去年10月份,該研究小組還取得了一項重要突破,他們利用一種工程設計的CRISPR Csy4 RNA內(nèi)切核糖核酸酶,來抑制HIV-1病毒感染。相關研究結果發(fā)表在國際學術期刊《PLOS ONE》。
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