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CNS高產(chǎn)學(xué)者Cell:線粒體代謝物測(cè)量新法

日期:2016-09-05 09:19:48

 最近,Whitehead研究所的科學(xué)家們開發(fā)出一種方法,可快速分離和系統(tǒng)地測(cè)量線粒體(被稱為細(xì)胞的“動(dòng)力室”)內(nèi)的代謝物濃度。之前嘗試這種測(cè)量,得到的結(jié)果不可靠,要么分離線粒體的時(shí)間太長(zhǎng),要么來自其他細(xì)胞成分的內(nèi)容物污染了線粒體代謝物。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在825日的《Cell》雜志。

 

領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是Whitehead研究所成員、霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所研究員、麻省理工學(xué)院(MIT)教授David Sabatini。這位科學(xué)家每年發(fā)表論文的數(shù)量大約為20篇,其中Nature、Science、Cell文章約為2篇左右。2015SabatiniCNS上發(fā)表的論文幾乎達(dá)到“刷屏”的程度,總數(shù)居然有10篇之多。

 

David Sabatini稱:“這種新方法的優(yōu)點(diǎn)在于,它將速度和特異性結(jié)合起來。我們對(duì)在體內(nèi)和其他細(xì)胞器(如溶酶體)中應(yīng)用這一流程而感到很興奮。”

 

通過精確控制的化學(xué)反應(yīng),線粒體以ATP的形式產(chǎn)生能量,并在細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)中發(fā)揮著重要的作用。線粒體功能障礙存在于一些疾病中,包括帕金森氏病、心血管疾病和線粒體疾病。到現(xiàn)在為止,探究這些重要細(xì)胞器的內(nèi)部代謝運(yùn)作,一直是具有挑戰(zhàn)性的和不準(zhǔn)確的。

 

分析線粒體代謝產(chǎn)物的常規(guī)方法,涉及使用幾輪的離心來純化線粒體,這個(gè)過程需要進(jìn)行一個(gè)多小時(shí)來完成。據(jù)David Sabatini實(shí)驗(yàn)室的研究生Walter Chen介紹,在研究代謝產(chǎn)物時(shí),時(shí)間是一個(gè)重要的問題。

 

Chen說:“即使你使樣品保持在4攝氏度或0攝氏度,以減緩任何反應(yīng),你得到的線粒體代謝曲線仍然逐漸失真,因?yàn)槊溉匀辉谄鹱饔?,所以轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白也在起作用。隨著時(shí)間的推移,線粒體在細(xì)胞外變得越來越不快樂了。”

 

另一種常用來分析線粒體代謝產(chǎn)物的方法,依賴于簡(jiǎn)化的離心分離,來分離線粒體。雖然更快,但是這個(gè)流程也帶來了非線粒體物質(zhì)和其他細(xì)胞器,因此由于來自其他線粒體的代謝產(chǎn)物,使得真正的線粒體信號(hào)失真。

 

為了減少分離線粒體需要的時(shí)間,同時(shí)增加代謝物分析的精度,Chen采取了一種完全不同的方法——快速純化。他將線粒體的外部涂上表位標(biāo)簽,并添加了覆蓋有標(biāo)簽特異性抗體的的微珠。通過鎖定這些標(biāo)簽,抗體將線粒體連接到微珠上,從而使Chen能夠容易地分離線粒體,打破線粒體,并在10分鐘內(nèi)停止所有的酶活性。根據(jù)他的分析,這種更快的方法所產(chǎn)生的結(jié)果,能夠更好地反映一個(gè)活細(xì)胞內(nèi)實(shí)際的線粒體代謝水平。

 

Chen指出:“根據(jù)目前為止我們的數(shù)據(jù)顯示,用這種方法分析線粒體,絕對(duì)會(huì)帶給你更大的分辨率,超過傳統(tǒng)方法分析整個(gè)細(xì)胞所獲得的分辨率。我認(rèn)為這將是相當(dāng)強(qiáng)大的,這正是我最興奮的地方。我已經(jīng)看到,這可能給人們指出了新的和有趣的方向。”

 

Chen說,該方法是非常靈活的,可以適用于分析其他細(xì)胞器的代謝產(chǎn)物,并能夠把受線粒體功能障礙影響的細(xì)胞(如受帕金森氏病損壞的神經(jīng)元)內(nèi)的線粒體,與似乎不受疾病影響的正常細(xì)胞或其他類型的細(xì)胞進(jìn)行比較。