韓國(guó)大邱慶北科學(xué)技術(shù)學(xué)院（DGIST）的研究人員建立了一個(gè)全面的遺傳信息公共數(shù)據(jù)庫(kù)（MTPrimerV），可用于RNA病毒的檢測(cè)和鑒定。在面對(duì)未來(lái)的公共衛(wèi)生事件時(shí)，這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)將是很有價(jià)值的工具。

RNA病毒可能引起許多傳染性的疾病，包括流行性感冒、脊髓灰質(zhì)炎和麻疹。近年來(lái)，許多新的致命疾病都由RNA病毒引起，最為人所熟知的是急性呼吸綜合征（SARS）和中東呼吸綜合征（MERS），兩者都造成嚴(yán)重的健康和經(jīng)濟(jì)影響。

2002年，中國(guó)南部爆發(fā)了嚴(yán)重的SARS疫情。最終，SARS病毒造成37個(gè)國(guó)家的774人死亡。去年，MERS病毒在韓國(guó)肆虐，造成旅游業(yè)收入銳減40%，對(duì)國(guó)民經(jīng)濟(jì)造成不利影響。

在這兩種情況下，疾病的快速傳播是由于病毒無(wú)法得到快速可靠的診斷。在疫情爆發(fā)時(shí)，準(zhǔn)確的病原體檢測(cè)和鑒定是必須的，有助于了解和控制疾病，從而盡量減少它對(duì)公共衛(wèi)生的影響。

因成本低、靈敏度和特異性高，PCR技術(shù)被廣泛用于病毒鑒定。在PCR鑒定中，引物設(shè)計(jì)是相當(dāng)重要的一環(huán)。然而，現(xiàn)在只有極少的在線數(shù)據(jù)庫(kù)提供了RNA病毒的高質(zhì)量引物，而且對(duì)應(yīng)用方面也有某些限制。

為了滿足這種需求，大邱慶北科學(xué)技術(shù)學(xué)院的Min-Soo Kim和JaeHyung Koo建立了一個(gè)全面的PCR引物數(shù)據(jù)庫(kù)，以便更快速、更高效地檢測(cè)和鑒定RNA病毒。他們?cè)凇?span lang="EN-US">Nucleic Acids Research》上介紹了這一成果。

這個(gè)名為MTPrimerV的數(shù)據(jù)庫(kù)包含了152,380,247對(duì)PCR引物，可檢測(cè)1818種病毒，覆蓋7144個(gè)基因編碼序列或CDS，這些序列是編碼蛋白質(zhì)的DNA或RNA中的一部分。

據(jù)介紹，這些引物能夠檢測(cè)NCBI RefSeq數(shù)據(jù)庫(kù)中包含的100%的RNA病毒。此外，MTPrimerV中的每對(duì)引物都經(jīng)過(guò)了人和病毒序列的嚴(yán)格相似性檢驗(yàn)，確保引物是高度特異性的。同時(shí)，MTPrimerV對(duì)最佳引物進(jìn)行排序，這樣用戶在單重PCR時(shí)只需挑選第一對(duì)引物，在雙重PCR時(shí)挑選前兩對(duì)引物即可。

“我們相信，MRPrimerV的開放將促進(jìn)病毒的宏基因組學(xué)研究，了解病毒的變異等等，并促進(jìn)人們?cè)谖磥?lái)更高效地應(yīng)對(duì)流行病，”研究人員總結(jié)道。