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中國農(nóng)大PNAS:體內(nèi)傳遞CRISPR文庫的一種有效新載體

日期:2017-01-10 09:05:55

 全基因組CRISPR/Cas9文庫大多數(shù)是用慢病毒載體構(gòu)建的,由于傳遞的效率低下,所以,直接的體內(nèi)篩選一直是難以實現(xiàn)的。16日在《PNAS》雜志上發(fā)表的一項研究中,來自中國農(nóng)業(yè)大學(xué)、德克薩斯大學(xué)健康科學(xué)中心和猶他大學(xué)等處的研究人員,研究了piggyBac (PB)轉(zhuǎn)座子作為傳遞向?qū)?/span>RNAgRNA)文庫的另一種載體,用于體內(nèi)篩選。

 

本文通訊作者是中國農(nóng)業(yè)大學(xué)生物學(xué)院的吳森教授和猶他大學(xué)醫(yī)學(xué)院的Mario R. Capecchi教授。吳森教授早年畢業(yè)于北京農(nóng)業(yè)大學(xué),主要研究方向為動物遺傳工程及干細(xì)胞。

 

在過去的十年中,轉(zhuǎn)座子誘變和RNA干擾介導(dǎo)的篩選,一直是用于小鼠體內(nèi)篩選和驗證癌基因的主要方法。然而,由于它們的效率低下,這兩種方法還沒有得以廣泛使用。最近,CRISPR/Cas9已經(jīng)發(fā)展為一種有效的誘變工具,并很快被作為一種技術(shù)用于體內(nèi)腫瘤誘發(fā)和癌基因的驗證。通過將CRISPR文庫轉(zhuǎn)染的癌細(xì)胞移植到免疫功能低下的小鼠體內(nèi),參與人類肺癌生長與轉(zhuǎn)移的幾個基因已經(jīng)得以鑒定。

 

然而,因為當(dāng)前病毒傳遞方法的局限性,直接的體內(nèi)基因組CRISPR篩選一直沒有獲得成功。此外,以前所有的篩選策略都有一些缺點。這些篩選通常開始于一個免疫功能不全的遺傳背景或攜帶多個預(yù)先設(shè)計突變的遺傳背景,所以結(jié)果可能并不適用于野生型小鼠。它們通常需要1 年以上才能獲得腫瘤。因此,迫切需要有一種替代的傳遞系統(tǒng),可以克服這些缺點,并可用于直接的體內(nèi)CRISPR篩選。

 

在這項研究中,研究人員研究了piggyBacPB)轉(zhuǎn)座子作為傳遞向?qū)?span lang="EN-US">RNAgRNA)文庫的另一種載體,用于體內(nèi)篩選。雖然先前研究人員已在小鼠中通過使用CRISPR/Cas9系統(tǒng)靶向癌基因?qū)崿F(xiàn)了腫瘤誘導(dǎo),但是,體內(nèi)的全基因組規(guī)模的篩查,仍未見報道。該研究小組利用他們的PB-CRISPR文庫,在小鼠體內(nèi)進(jìn)行了全基因組篩選,并鑒定了介導(dǎo)小鼠肝腫瘤發(fā)生的基因,包括已知的和未知的腫瘤抑制基因(TSGs)。這些研究結(jié)果表明,PB可能是有效的CRISPR文庫體內(nèi)傳遞的一種簡單的和非病毒性的選擇。

 

特別關(guān)注