眾所周知，癌癥是一種異質(zhì)性的疾病，有許多不同的亞型。這些癌癥依賴(lài)不同的通路來(lái)存活，對(duì)癌癥治療藥物也有著不同的反應(yīng)。對(duì)研究人員來(lái)說(shuō)，挑戰(zhàn)在于如何精確定義這些不同的通路，并找到脆弱之處，以此作為藥物治療的靶點(diǎn)。

近日，美國(guó)Whitehead研究所和Broad研究所的研究人員在這方面邁出了重要一步：他們成功鑒定出14種人類(lèi)急性髓性白血?。?span lang="EN-US">AML）細(xì)胞系中的一組關(guān)鍵基因，它們是細(xì)胞增殖和存活所必需的。將這份“基因必要性圖譜”與現(xiàn)有的基因組信息相結(jié)合，此研究將有助于新療法的開(kāi)發(fā)。這項(xiàng)研究成果于2月2日發(fā)表在《Cell》雜志上。

在這項(xiàng)研究中，研究人員將重點(diǎn)放在與Ras癌基因相關(guān)聯(lián)的基因和蛋白通路上。Ras基因是人類(lèi)癌癥中經(jīng)常發(fā)生突變的癌基因，在急性髓性白血病及其他癌癥中發(fā)揮重要作用。

這篇論文的第一作者，Whitehead研究所和Broad研究所的研究生Tim Wang表示：“在大多數(shù)情況下，Ras蛋白的突變體都被認(rèn)為是‘無(wú)藥可靶向的（undruggable）’。不過(guò)，替代方法是找到Ras突變癌癥依賴(lài)的其他基因，希望其中的一個(gè)能夠成為藥物靶點(diǎn)。不幸的是，這種‘Ras合成致死’基因目前仍難以確定。”

于是，研究人員利用基于CRISPR的遺傳篩查技術(shù)，全面評(píng)估18,000個(gè)蛋白編碼基因?qū)θ祟?lèi)基因組的影響。這些數(shù)據(jù)的分析以及后續(xù)工作揭示了之前未研究的基因的分子功能，鑒定出與Ras突變體的致死相互作用。這篇論文的資深作者、麻省理工學(xué)院的David Sabatini表示：“這個(gè)過(guò)程能夠讓我們鑒定出Ras突變細(xì)胞所必需的基因列表。”

同時(shí)，研究人員也關(guān)注了一些基因，它們?cè)谀承┘?xì)胞系中必不可少，而在其他細(xì)胞系中可有可無(wú)。對(duì)于每一個(gè)基因，研究人員通過(guò)數(shù)據(jù)篩選，找到必要性模式匹配的其他基因，認(rèn)為它們有著類(lèi)似的功能。事實(shí)上，這種分析揭示了共同作用的基因組合，并發(fā)現(xiàn)了之前未知或未研究過(guò)的基因關(guān)聯(lián)。