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兩步序列捕測新法 或引發(fā)農(nóng)作物遺傳革命

日期:2010-04-27 17:02:43

一種用于高度復雜的玉米基因組靶向測序的新方法可能會引發(fā)重要農(nóng)業(yè)作物的遺傳學研究革命。由于許多重要農(nóng)業(yè)作物的基因組龐大且重復度極高,所以開發(fā)一種技術來將基因組拆開并進一步捕捉感興趣的部分是一項具有重要意義的工作。以玉米為例,其基因組中只有15%的部分表現(xiàn)出序列變異。

  這種兩步序列捕捉方法不需要封阻DNA,它能阻止基因組中重復序列對捕捉過程的影響。封阻DNA是一種特異性試劑,針對每一個物種大量生產(chǎn)高質(zhì)量的試劑還存在技術上的困難。這種新方法不需要使用封阻DNA,其操作過程分為兩步,首先利用基因芯片將重復順序去除,然后再對特殊的目標片段進行捕捉??茖W家們利用這種兩步法成功的對玉米基因組中的目標序列進行幾千倍的富集,覆蓋度也達到了很高的水平。

  “除了應用于農(nóng)業(yè)系統(tǒng)外,這種技術還可直接用于森林樹木等非食用作物,甘蔗、芒草等能源作物,以及一些植物藥材等,它能幫助解決基因結構及基因進化方面的相關問題。上述作物的基因組比玉米大許多,其中大多數(shù)額外序列都是由重復DNA組成?!狈鹆_里達州立大學生物學助理教授Brad  Barbazuk說。