小核糖核酸（miRNA）研究領(lǐng)域中的一個最大問題便是搞清這些小型的 RNA如何在動物體內(nèi)抑制它們的信使RNA（mRNA）目標。早期的研究表明，miRNAs的活動減少了轉(zhuǎn)譯的效率，但對于目標mRNA的水平只有相對較小的影響。然而，來自美國科學(xué)家的新證據(jù)表明，就像在植物中一樣，miRNAs通過減少目標mRNA的水平而顯著發(fā)揮了它們對于哺乳動物細胞的影響。  

馬薩諸塞州劍橋市懷特海德生物醫(yī)學(xué)研究所的Huili  Guo、David  Bartel和同事利用核糖體圖譜——基于mRNA片段深度測序的一種靈敏的方法——分析了miRNAs對其在人類和小鼠細胞中的靶點的影響。他們描述了轉(zhuǎn)染miRNA細胞和模擬轉(zhuǎn)染細胞，同時在每個樣本中完成了mRNA測序。這一策略使得研究人員能夠直接將mRNA上的核糖體密度與mRNA豐度進行比較，進而比較miRNA在一個特定時間點上對轉(zhuǎn)錄水平和轉(zhuǎn)錄效率的影響。    

研究人員分析了向子宮頸癌細胞——miRNA在子宮頸癌細胞中缺乏正常的表達——中引入miR-1或miR-155的影響，以及在小鼠的嗜中性粒細胞中敲掉mir-223（一種內(nèi)生表達的miRNA），此時這3種miRNA的影響已經(jīng)被數(shù)千種細胞蛋白質(zhì)所確定。miRNA似乎并沒有抑制目標 mRNA，這意味著，miRNA的抑制效應(yīng)獨立于目標的表達水平。    

Bartel和同事于是鑒別出了一套被他們稱為“蛋白質(zhì)組學(xué)支持目標”的目標mRNA，這是因為蛋白質(zhì)組學(xué)分析表明，這些目標的蛋白質(zhì)水平也存在一個巨大的變化。對于這一系列目標而言，研究人員發(fā)現(xiàn)了所有3種miRNA在轉(zhuǎn)染效率上適度但在統(tǒng)計學(xué)上具有意義的影響——約占11%到16%的目標表達。這些結(jié)果意味著，至少84%的由miRNA調(diào)節(jié)的目標抑制是緣于mRNA水平的減少，這比之前利用陣列分析獲得的估計值要大。此外，研究人員的結(jié)果還表明，miRNAs對于其目標的蛋白質(zhì)產(chǎn)出的影響能夠通過利用mRNA測序分析轉(zhuǎn)錄水平而加以評估。研究人員在最近出版的《自然》雜志上報告了這一研究成果。       

研究人員指出，下一步將是搞清這種轉(zhuǎn)錄擾動情況是否適用于其他細胞類型，以及確定miRNA擾亂其miRNA目標的根本機制。