施一公研究組最新Nature文章
日期:2010-12-03 13:39:36
文章的通訊作者是清華大學(xué)生命科學(xué)院院長施一公教授,其研究組主要致力于運用結(jié)構(gòu)生物學(xué)和生物化學(xué)的手段研究腫瘤發(fā)生和細胞調(diào)亡的分子機制,集中于腫瘤抑制因子和細胞凋亡調(diào)節(jié)蛋白的結(jié)構(gòu)和功能研究、重大疾病相關(guān)膜蛋白的結(jié)構(gòu)與功能的研究、胞內(nèi)生物大分子機器的結(jié)構(gòu)與功能研究。另外兩位作者分別是王佳偉(Jiawei Wang)和張鵬(Peng Zhang)。
近期研究發(fā)現(xiàn)了一類重要的蛋白:能量耦合因子(energy-coupling factor,ECF)轉(zhuǎn)運蛋白,這類蛋白是一些微量營養(yǎng)元素的運輸因子,負責(zé)原核生物的維生素攝入運輸。每個ECF轉(zhuǎn)運因子都包含一種嵌入細胞膜,能結(jié)合底物的蛋白結(jié)構(gòu):S組件,這一結(jié)構(gòu)是能量耦合的關(guān)鍵部件,由兩個ATP結(jié)合蛋白和一個跨膜蛋白組成。然而目前這一結(jié)構(gòu)的具體構(gòu)架,以及運輸機制并不清楚。
在這篇文章中,研究人員確定了金黃葡萄球菌核黃素轉(zhuǎn)運因子的S組件,即RibU的X-射線晶體結(jié)構(gòu),這一分辨率為3.6-Å的結(jié)構(gòu)顯示,RibU包含了6個跨膜區(qū)域,這6個區(qū)域以一種之前未見報道的方式折疊(如下圖),其中核黃素是綁定在L1環(huán)和幾個跨膜片段的周質(zhì)部分上的。這種“膜嵌入基質(zhì)結(jié)合域”結(jié)構(gòu)揭示了一種保守的蛋白結(jié)構(gòu)特征,也說明了ECF轉(zhuǎn)運因子的運輸機制。
膜蛋白的結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究一直以來是結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域公認的重點及難點。1985年,第一個膜蛋白結(jié)構(gòu)問世,當(dāng)時共計僅有不到200個生物大分子結(jié)構(gòu)。而時至今日,PDB收錄的近7萬個生物大分子結(jié)構(gòu)中,膜蛋白結(jié)構(gòu)不到700個,其中新型的膜蛋白結(jié)構(gòu)又只有250多個(Membrane Proteins of Known 3D Structure),足見膜蛋白結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究的困難。清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)中心在過去兩年間相繼報道了3個新型膜蛋白的4個晶體結(jié)構(gòu),由于其創(chuàng)新性和重要性,四篇學(xué)術(shù)論文全部發(fā)表于《自然》或《科學(xué)》,為我國的膜蛋白結(jié)構(gòu)生物學(xué)研究作出了重要貢獻,其成果在國際結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域獲得了充分關(guān)注。