專家解析單分子細(xì)胞分析技術(shù)(一)
日期:2010-12-30 08:39:06
隨著對細(xì)胞生理研究的逐漸深入,科學(xué)家們開始解析單個細(xì)胞的行為,這是因為即使是同樣的遺傳物質(zhì),同樣的周邊環(huán)境,這些細(xì)胞還是會朝著不同的方向發(fā)展,有時還會生成不同的功能,而且單個細(xì)胞的變化還關(guān)系到癌癥,神經(jīng)疾病等疾病。
然而要分析單個細(xì)胞,卻不是那么容易的事情,在基因表達(dá)分析中占據(jù)主要位置的DNA芯片這種分析方法,由于靈敏度不夠,所以不足以發(fā)現(xiàn)單個細(xì)胞水平上的差異,但是從單個細(xì)胞中挑選少量RNAs,或者蛋白也不容易做到,而且如果還要分析細(xì)胞的動力學(xué)因素,那就不只是繁瑣實驗的問題,還需要物理學(xué),機(jī)械學(xué),和生物學(xué)的多方配合。
來自斯坦福大學(xué)的單分子研究專家Stephen Quake研究組在單分子實驗中也遇到了相同的問題,他們希望能檢測相同細(xì)胞對于相同信號的反應(yīng),之前研究人員已經(jīng)利用定量PCR進(jìn)行了批量分析,但是他們還是希望能就單個細(xì)胞如何對不同濃度的信號分子TNF-α產(chǎn)生相應(yīng)的響應(yīng)進(jìn)行分析。
細(xì)胞信號交流調(diào)控著基本的細(xì)胞活性以及人體中相應(yīng)的細(xì)胞活動。細(xì)胞準(zhǔn)確應(yīng)答周圍環(huán)境的能力是發(fā)育、組織修復(fù)和免疫的基礎(chǔ)。深入理解細(xì)胞間的相互交流將有助于了解生物系統(tǒng)的復(fù)雜性,或能開發(fā)出癌癥,糖尿病及其他自身免疫疾病的新療法。
因此Quake研究組探索出來一種新方法來觀察單一細(xì)胞在細(xì)胞信號復(fù)雜系統(tǒng)中的應(yīng)答反應(yīng),這種方法就是高通量的微流體細(xì)胞培養(yǎng)(high- throughput microfluidic cell culture),將這一技術(shù)與熒光顯微鏡,定量基因表達(dá)分析和建立數(shù)學(xué)模型等研究手段結(jié)合起來,Quake研究組首次發(fā)現(xiàn)相同細(xì)胞之間存在大范圍的差異,并且指出了科學(xué)家的一些認(rèn)識可能已經(jīng)被基于細(xì)胞群體研究的結(jié)果所誤導(dǎo)。
細(xì)胞活化這一結(jié)果是一樣的,然而細(xì)胞達(dá)到結(jié)果的過程可能是不一樣的,群體研究不能顯示信息錯綜復(fù)雜的信號網(wǎng)絡(luò)中的差異,而這在單一細(xì)胞水平中可以觀察到。
研究人員利用不同的蛋白濃縮物刺激細(xì)胞,這些濃縮物是免疫系統(tǒng)應(yīng)答炎癥或癌癥反應(yīng)的代表性物質(zhì)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),一些細(xì)胞接受信號并被激活,而一些細(xì)胞則沒有激活。研究人員人員觀察到細(xì)胞以不同的方式產(chǎn)生應(yīng)答,但是細(xì)胞的基本反應(yīng)在許多方面是一致的。
這種方法的優(yōu)勢是效率十分高——利用這種方法,研究人員能同時處理成百上千的細(xì)胞,并且觀察長達(dá)4天的時間里,這些細(xì)胞的反應(yīng)。而缺點就是微流體實驗并不容易操作,因此一定要考慮清楚。如果你希望觀測細(xì)胞對于一個信號刺激的反應(yīng),那么也許一個96孔板就能搞定,但是如果你希望了解細(xì)胞在系列環(huán)境中的反應(yīng),那么微流體實驗也許更加合適,具體來說還得看個人的情況。
Quake研究組今年在單分子研究方面還獲得了另外一項重要的成果:他們發(fā)展了一種平價的單分子光譜技術(shù),所謂單分子光譜,其實主要用來研究納米領(lǐng)域,其基本觀念非常簡單:就是一次只觀測一個生物分子或納米粒子,因此可以輕易觀測到很多分子尺度的動態(tài)過程,蛋白質(zhì)分子折迭(folding)即為一例。為了達(dá)到單分子光譜的靈敏度,關(guān)鍵之一就是要利用高數(shù)值孔徑(numerical aperture, NA)的物鏡來聚焦及收光,然而高NA的物鏡價格相對昂貴,而且還會衍生一些實驗測量上的問題。
為了解決這一問題,以及無法做長時間觀察,觀察視野較小及工作距離較短的問題,研究人員將具有高折射率的二氧化鈦(TiO2)微米球放在單熒光分子及物鏡中間,讓TiO2微米球們扮演微透鏡(microlens)的角色,將熒光分子所發(fā)出的光聚焦至物鏡。這種結(jié)合微透鏡及平價低NA(=0.5)物鏡的作法,可偵測單分子訊號而不會有熱效應(yīng)的問題,因此能做長期觀測。他們利用這項技術(shù)成功地在70°C的高溫下,觀察到單一酶的活動過程。
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