美國(guó)能源部屬下的橡樹(shù)嶺國(guó)家實(shí)驗(yàn)室開(kāi)發(fā)的一種更為快捷和廉價(jià)的掃描分子數(shù)據(jù)庫(kù)的技術(shù)，能使科學(xué)家進(jìn)入開(kāi)發(fā)新的治療藥物的快速通道。

        田納西大學(xué)-橡樹(shù)嶺國(guó)家實(shí)驗(yàn)室分子生物物理學(xué)中心的杰羅姆·鮑德利領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊(duì)對(duì)一種廣泛使用的現(xiàn)有軟件進(jìn)行改編，以用于像橡樹(shù)嶺國(guó)家實(shí)驗(yàn)室裝備的“美洲虎”這樣的超級(jí)計(jì)算機(jī)，對(duì)海量分子數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行篩選，并確定可以作為潛在藥物候選分子的化合物。  

        這一研究結(jié)果發(fā)表于近期出版的《計(jì)算化學(xué)學(xué)報(bào)》。  

        “我們的研究彌補(bǔ)了超級(jí)計(jì)算機(jī)與像人類(lèi)基因組計(jì)劃這樣的現(xiàn)有分子數(shù)據(jù)庫(kù)海量數(shù)據(jù)之間缺失的一環(huán)，”鮑德利表示，“我們面臨雪崩式的數(shù)據(jù)，現(xiàn)在需要將這些數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)化為知識(shí)?！?nbsp; 

        這種轉(zhuǎn)換是藥物開(kāi)發(fā)第一階段的關(guān)鍵所在，研究人員通常在此階段尋找與體內(nèi)靶點(diǎn)相互作用的適宜化合物，靶點(diǎn)通常為一種蛋白質(zhì)。如果這種化合物是合適的，將會(huì)附著到蛋白質(zhì)上，并在細(xì)胞內(nèi)產(chǎn)生理想的效果。  

        但對(duì)數(shù)千種已知蛋白質(zhì)和數(shù)百萬(wàn)中可能作為潛在藥物的化合物來(lái)講，可能的組合是一個(gè)天文數(shù)字。  

        “用實(shí)驗(yàn)來(lái)測(cè)定這些相互作用非常昂貴和費(fèi)時(shí)，”鮑德利表示，“但使用超級(jí)計(jì)算機(jī)，我們一天可以處理數(shù)百萬(wàn)個(gè)分子?！?nbsp; 

        快速高效的分子處理為科學(xué)家們提供了冒著風(fēng)險(xiǎn)研究之前未經(jīng)檢測(cè)的藥物候選分子的一個(gè)機(jī)會(huì)，可能導(dǎo)致開(kāi)發(fā)出多元化和創(chuàng)新種類(lèi)的藥物。  

        “在此之前，由于分子不具備滿意的特性，我們?nèi)拥袅撕芏嘈畔?，”鮑德利表示，“現(xiàn)在，可以對(duì)每一個(gè)分子進(jìn)行檢查，不必?fù)?dān)心浪費(fèi)資源?！?nbsp; 

        通過(guò)獲得國(guó)立衛(wèi)生研究院支持的一項(xiàng)協(xié)作計(jì)劃，研究人員已經(jīng)著手將這一研究變?yōu)槭聦?shí)。項(xiàng)目團(tuán)隊(duì)計(jì)劃使用橡樹(shù)嶺國(guó)家實(shí)驗(yàn)室的超級(jí)計(jì)算機(jī)尋找可能治療前列腺癌的化合物。這一研究由NIH臨床轉(zhuǎn)移科學(xué)獎(jiǎng)勵(lì)計(jì)劃資助，這項(xiàng)研究由喬治城大學(xué)和霍華德大學(xué)牽頭，主要參與方包括橡樹(shù)嶺國(guó)家實(shí)驗(yàn)室、MedStarHealth組織和華盛頓特區(qū)退伍軍人醫(yī)療中心。