揭示酶自剪切分子機(jī)制
日期:2011-05-26 08:26:32
領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是上海交通大學(xué)鄧子新院士,其早年畢業(yè)于華中農(nóng)業(yè)大學(xué),2005年當(dāng)選為中國科學(xué)院院士。鄧子新院士長期從事微生物分子生物學(xué)研究,在重要類別抗生素生物合成基因克隆、定位、結(jié)構(gòu)功能分析、表達(dá)和遺傳調(diào)控機(jī)制、抗生素代謝工程與藥物創(chuàng)新、天然產(chǎn)物的生物化學(xué)與組合生物合成等方面取得了系統(tǒng)性研究進(jìn)展。
在這篇文章中博士研究生殷俊等揭示了頭孢菌素?;傅诙阶约羟惺怯捎诜肿觾?nèi)相互作用,并由N-端親和基團(tuán)(Ntn)催化完成。這一新催化模型的提出預(yù)示著在剪切過程中,該酶必須經(jīng)歷一個(gè)很大的構(gòu)象變化,以克服距離約22?的空間障礙。結(jié)合晶體學(xué)數(shù)據(jù),運(yùn)用高分辨質(zhì)譜分析技術(shù)對(duì)頭孢菌素?;缚臻g肽的研究,為酶催化的動(dòng)態(tài)機(jī)制提供了重要的實(shí)驗(yàn)證據(jù)。此外,文章還揭示了頭孢菌素酰化酶是一個(gè)?;拿?,并具有一定的外切肽酶活性,深入探討了有關(guān)弱催化機(jī)制與分子內(nèi)張力的相互關(guān)系,豐富了酶催化的理論知識(shí)。
2011年鄧子新院士研究團(tuán)隊(duì)在抗生素生物合成和分子酶學(xué)研究領(lǐng)域取得了一系列新成果。在今年3月發(fā)表在同一期刊的論文中,博士研究生黃婷婷等運(yùn)用現(xiàn)代分子生物學(xué)與天然產(chǎn)物化學(xué)技術(shù),成功克隆了具有顯著抗結(jié)核分支桿菌活性的抗生素吡啶霉素的生物合成基因簇,通過系統(tǒng)的體內(nèi)遺傳學(xué)和體外分子酶學(xué)研究闡明了該抗生素生物合成的起始機(jī)制,證實(shí)了嵌合在非核糖體合成酶中的聚酮還原酶結(jié)構(gòu)域的功能,并推測(cè)出兩個(gè)吡啶環(huán)的生物合成模型。在此基礎(chǔ)上運(yùn)用前體導(dǎo)向的生物合成技術(shù),獲得了三個(gè)新結(jié)構(gòu)吡啶霉素類似物,為成功利用組合生物合成技術(shù)產(chǎn)生新結(jié)構(gòu)、新活性的藥物或先導(dǎo)化合物奠定了基礎(chǔ)。