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RNA與DNA序列存廣泛差異

日期:2011-05-30 08:11:06

近日來(lái)自美國(guó)賓夕法尼亞大學(xué)醫(yī)學(xué)院及北卡羅來(lái)納州立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的研究人員在新研究中驚異地發(fā)現(xiàn)RNA與DNA序列之間存在廣泛的差異,這表明信使RNA有可能將遺傳信息從細(xì)胞DNA攜帶至蛋白質(zhì)加工廠的過(guò)程中以某種未知的機(jī)制進(jìn)行了重新編輯。這一研究成果在線發(fā)表在5月19日的《科學(xué)》(Science)雜志上。
 
如果這一研究發(fā)現(xiàn)是真實(shí)的話,那將成為本年度最重要的發(fā)現(xiàn),從而導(dǎo)致分子生物學(xué)中的“遺傳中心法則”被改寫(xiě)?!爸行姆▌t”認(rèn)為細(xì)胞中的遺傳信息是以DNA為模板通過(guò)轉(zhuǎn)錄傳遞給RNA,再由RNA指導(dǎo)蛋白質(zhì)合成。在這一過(guò)程中遺傳信息傳遞完全忠實(shí)于最初的DNA模板。在新論文中研究人員提出RNA在進(jìn)入蛋白質(zhì)加工廠前有可能通過(guò)一種“RNA編輯”( RNA editing )的方式置換了部分的堿基,從而導(dǎo)致了生成蛋白質(zhì)的改變。
 
在這篇文章中,賓夕法尼亞大學(xué)的Vivian Cheung帶領(lǐng)研究小組對(duì)參與了千人基因組計(jì)劃(the 1000 Genomes Project)和國(guó)際單體型計(jì)劃(the International HapMap Project)的27個(gè)人的全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果進(jìn)行了分析。經(jīng)過(guò)比較,研究人員發(fā)現(xiàn)大量的RNA與其模板DNA序列不一致,他們?cè)谕怙@子中發(fā)現(xiàn)了超過(guò)1萬(wàn)個(gè)不同的位點(diǎn)。由于在不同的人中存在有相同的錯(cuò)配,從而表明這些并非是轉(zhuǎn)錄過(guò)程中的隨機(jī)錯(cuò)誤。進(jìn)而他們證實(shí)這些“錯(cuò)配”的RNA也參與指導(dǎo)合成了蛋白質(zhì)。
 
“當(dāng)我們證實(shí)這些差異通過(guò)翻譯傳遞至蛋白質(zhì)序列中時(shí),我們就非常肯定它們是在生物過(guò)程中衍生出來(lái)的,”Cheung說(shuō)。
 
RNA編輯并非是一個(gè)新提出來(lái)的概念。過(guò)去有人發(fā)現(xiàn)一種叫做ADAR的酶可誘導(dǎo)人類細(xì)胞在RNA翻譯合成蛋白質(zhì)的過(guò)程中將腺嘌呤堿基當(dāng)做鳥(niǎo)嘌呤。此外,RNA編輯也被發(fā)現(xiàn)存在于植物和人類寄生蟲(chóng)中。
 
然而在這篇文章中作者們提出的RNA編輯卻不同尋常。研究人員人員發(fā)現(xiàn)平均每個(gè)人大約存在1065個(gè)這樣的RNA與DNA序列差異(RNA–DNA differences)。其中一些錯(cuò)配的堿基改變并非通過(guò)已知的RNA編輯機(jī)制產(chǎn)生,這表明還存在其他未知的作用機(jī)制。
 
“這從一個(gè)完全不同的層面揭示了在RNA水平上進(jìn)行的基因調(diào)控,”美國(guó)費(fèi)城威斯達(dá)研究所的分子生物學(xué)家Kazuko Nishikura說(shuō):“現(xiàn)在最大的挑戰(zhàn)是要弄清楚這些RNA序列改變的分子機(jī)制?!?/DIV>
 
不過(guò)目前也有一些科學(xué)家對(duì)此持懷疑態(tài)度。加州大學(xué)的比較基因組學(xué)家Lior Pachter認(rèn)為這一研究結(jié)果有可能是Cheung的研究小組在使用高通量測(cè)序儀進(jìn)行測(cè)序時(shí)產(chǎn)生的系統(tǒng)誤差,因?yàn)槠渲幸恍╁e(cuò)配發(fā)生在極易出現(xiàn)系統(tǒng)RNA測(cè)序錯(cuò)誤的位點(diǎn)。
 
如果這一研究發(fā)現(xiàn)被證實(shí)是真實(shí)的結(jié)果,這無(wú)疑對(duì)于與生物學(xué)而言具有極其重要的意義,或?qū)⒂绊懣蒲腥藛T研究基因組學(xué)的途徑。哈德遜-阿爾法生物科技研究所(Hudson-Alpha Institute for Biotechnology)的研究事物主管Chris Gunter認(rèn)為:“這將有可能為遺傳學(xué)家們帶來(lái)更多更有趣的疑問(wèn)?!?/DIV>