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解析基因剪接調(diào)控機(jī)制

日期:2011-07-05 08:11:07

近日來自北京生命科學(xué)研究所的研究人員在PLoS Genetics雜志上發(fā)表題為“Transportin-SR Is Required for Proper Splicing of Resistance Genes and Plant Immunity”的文章。

這篇文章的通訊作者是北京生命科學(xué)研究所的青年研究員張躍林博士,其早年畢業(yè)于復(fù)旦大學(xué)遺傳學(xué)及遺傳工程專業(yè),實(shí)驗(yàn)室的研究方向主要為先天性免疫和功能基因組學(xué)。博士研究生許少華為本文的第一作者,參與此工作的還有張志斌、荊貝貝和丁金美以及University of British Columbia的Patrick Gannon、徐芳和李昕教授。

由植物抗性 (Resistance, R) 基因編碼的免疫受體在植物抗擊病原菌的免疫過程中發(fā)揮了重要作用。植物中很多R基因,包括SNC1和RPS4都存在選擇性剪接,然而植物體調(diào)控R基因剪接的機(jī)制目前還知之甚少。

在這篇文章中,研究人員證實(shí)MOS14 (modifier of snc1-1, 14)的突變抑制了snc1植物中組成性激活的免疫反應(yīng)。圖位克隆和生物信息學(xué)分析顯示MOS14編碼了一個(gè)和動(dòng)物中Transportin-SR (TRN-SR) 存在序列相似性的蛋白。TRN-SR是importin-beta超家族的一個(gè)成員,它負(fù)責(zé)serine-arginine rich (SR) 蛋白的入核轉(zhuǎn)運(yùn),而SR蛋白在RNA代謝過程中發(fā)揮著重要作用。熒光共聚焦實(shí)驗(yàn)顯示MOS14定位在細(xì)胞核中,酵母雙雜交顯示MOS14的C端可以和SR蛋白相互作用,其N端可以和小G蛋白AtRAN1相互作用。SR蛋白在Col-0中定位于細(xì)胞核,然而在mos14-1突變體中,SR蛋白卻分散在整個(gè)細(xì)胞中。另外,有幾個(gè)發(fā)生選擇性剪接的基因在mos14-1中的選擇性剪接模式發(fā)生了改變,這些實(shí)驗(yàn)證明MOS14編碼了擬南芥中一個(gè)TRN-SR蛋白。

進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)表明MOS14的突變導(dǎo)致了SNC1和RPS4這兩個(gè)R基因選擇性剪接模式的改變,從而減弱了它們激活的免疫反應(yīng)。這些實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,由MOS14介導(dǎo)的SR蛋白的入核對(duì)于這兩個(gè)R基因的正確剪接以及它們?cè)谥参镏薪閷?dǎo)的免疫反應(yīng)是非常重要的。

此項(xiàng)研究為科技部和北京市科委資助課題,在北京生命科學(xué)研究所完成。