DNA條形碼技術(shù)有助貝類多樣性研究
日期:2011-07-27 08:55:44
近日,來(lái)自中國(guó)海洋大學(xué)水產(chǎn)學(xué)院的研究人員在美國(guó)《公共科學(xué)圖書館—綜合》(PLoS ONE)上發(fā)表了題為“How DNA Barcodes Complement Taxonomy and Explore Species Diversity: The Case Study of a Poorly Understood Marine Fauna”的研究論文。
簾蛤科是海洋雙殼貝類中物種數(shù)量最多的一個(gè)門類,命名的種類有500余種,其中許多種類具有重要經(jīng)濟(jì)價(jià)值。然而,由于種內(nèi)和種間表型的多態(tài)性,一些簾蛤科貝類很難單靠形態(tài)特征來(lái)鑒定。近年來(lái),人類活動(dòng)帶來(lái)的空前的生物多樣性危機(jī)日益嚴(yán)重,為了準(zhǔn)確評(píng)估生物多樣性并進(jìn)一步有效保護(hù)這些形態(tài)分類混亂的簾蛤貝類,亟需一種快速而且簡(jiǎn)單的方法來(lái)界定它們的種的界限。
該研究利用基于線粒體COI基因的DNA條形碼技術(shù),分析了中國(guó)沿海60種簾蛤貝類的315個(gè)體,發(fā)現(xiàn)幾乎所有形態(tài)上能夠鑒定到種的個(gè)體都形成獨(dú)自的DNA條形碼簇;形態(tài)上不能確定種名的26個(gè)體中,12個(gè)體被鑒定到已知種,其余14個(gè)體形成5個(gè)單獨(dú)的支系,可能代表未描述的新種,或者至少是在國(guó)內(nèi)未記錄的種類。此外,在5個(gè)傳統(tǒng)的形態(tài)種中發(fā)現(xiàn)隱存種的存在。該研究證實(shí)了DNA條形碼技術(shù)能有效鑒定海洋貝類,同時(shí)能通過(guò)為分類修訂提供有用信息、指示鑒別性的形態(tài)特征和標(biāo)示隱存種,輔助分類和評(píng)估生物多樣性。這是迄今為止國(guó)內(nèi)外最大規(guī)模的海洋貝類DNA條形碼研究。美國(guó)洛克菲勒大學(xué)Mark Stoeckle教授在DNA條形碼博客(http://phe.rockefeller.edu/barcode/blog)中介紹了該研究成果,并對(duì)作者首次提出的DNA條形碼除具有物種鑒定和隱存種發(fā)掘作用外,還具有“Taxonomy disentanglement”第三種作用的觀點(diǎn)予以充分肯定。
該論文是在李琪教授的指導(dǎo)下,由博士研究生陳軍等完成。該研究得到了國(guó)家863計(jì)劃和國(guó)家自然科學(xué)基金課題的資助。