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科學(xué)家提出DNA物種識別新方法

日期:2011-09-29 08:36:40

近日首都師范大學(xué)生科院張愛兵教授在著名的進(jìn)化、生態(tài)學(xué)國際期刊《分子生態(tài)學(xué)》(Molecular Ecology)上發(fā)表了DNA條形碼研究新成果。

 

張愛兵教授系首都師范大學(xué)“海外引進(jìn)人才”,現(xiàn)為首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院分子生態(tài)學(xué)學(xué)科帶頭人,博士生導(dǎo)師。其領(lǐng)導(dǎo)的研究團(tuán)隊致力于DNA條形碼理論與應(yīng)用、有害生物的分子識別和生態(tài)安全,目前承擔(dān)有國家自然科學(xué)基金面上項(xiàng)目等,是國際DNA條形碼理論研究領(lǐng)域少數(shù)幾個研究團(tuán)隊之一,在相關(guān)領(lǐng)域具有較強(qiáng)的國際影響力。

                       

DNA條形碼研究是國際生態(tài)學(xué)、進(jìn)化生物學(xué)領(lǐng)域新興的交叉研究領(lǐng)域(分子生物學(xué),經(jīng)典分類學(xué),生態(tài)學(xué)以及計算機(jī)科學(xué)的交叉),由加拿大科學(xué)家P.Hebert2003年提出,在國際生物學(xué)相關(guān)領(lǐng)域引起廣泛關(guān)注。DNA條形碼研究極大地促進(jìn)了生物多樣性保護(hù)、外來入侵和有害生物分子識別等相關(guān)領(lǐng)域的研究。

 

在這篇文章中,張教授將模糊數(shù)學(xué)理論引入到DNA條形碼研究領(lǐng)域,提出了基于模糊成員關(guān)系與最小遺傳距離的DNA物種識別新方法。他通過實(shí)例研究和超過5000次的計算機(jī)模擬,證明該方法明顯優(yōu)于常用的基于Bayesian理論的方法和基于NJ建樹的方法,尤其能夠降低DNA條形碼識別中的假陽性錯誤。

 

此研究是張愛兵教授繼2008年將人工智能的思想引入到DNA條形碼(DNA barcoding)研究領(lǐng)域后,在該領(lǐng)域內(nèi)取得的又一次理論突破。

 

特別關(guān)注