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2011值得關(guān)注的技術(shù):RNA結(jié)構(gòu)

日期:2012-01-12 08:51:15

Nature Methods》盤點(diǎn)2011年度技術(shù),選出了最受關(guān)注的技術(shù)成果:人工核酸酶介導(dǎo)的基因組編輯(genome editing with engineered nucleases)技術(shù)。

 

除了進(jìn)一步編輯以外,《Nature Methods》也整理出了2011年最值得關(guān)注的幾項(xiàng)技術(shù),分別為:?jiǎn)渭?xì)胞技術(shù)(Single-cell methods)、功能基因組資源(Functional genomic resources)、糖蛋白組學(xué)(Glycoproteomics)、單倍體因果突變(Causal mutations in a haploid landscape)、單層光生物成像(Imaging life with thin sheets of light)、非模式生物(Nonmodel organisms)、光基礎(chǔ)電生理學(xué)(Light-based electrophysiology)和RNA結(jié)構(gòu)(RNA structures )。

 

RNA結(jié)構(gòu),尤其是RNA轉(zhuǎn)錄復(fù)合物的結(jié)構(gòu)研究,已經(jīng)引起了不少科學(xué)家們的關(guān)注,2011RNA結(jié)構(gòu)精確分析方法取得了一些重要進(jìn)展。

 

雖然RNA轉(zhuǎn)錄體合成的時(shí)候是線性結(jié)構(gòu),但是其折疊后的結(jié)構(gòu)在細(xì)胞生理機(jī)制作用中扮演了重要角色。現(xiàn)代生命科學(xué)研究表明,RNA的作用遠(yuǎn)不止是信使,傳遞信息,或者作為核糖體中的RNA成分。像是RNA剪接和編輯,維持端粒,蛋白分泌表達(dá),小分子感應(yīng)和應(yīng)答催化,都是近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的RNA的新功能。RNA如何行使這些功能,是解開許多生物學(xué)作用迷題的關(guān)鍵,而要回答這個(gè)問(wèn)題,常常需要依賴于解密RNA結(jié)構(gòu)。

 

但是要了解RNA的結(jié)構(gòu),并不容易,許多RNAs保守性不高,其功能不能通過(guò)簡(jiǎn)單的同源篩選就可以發(fā)現(xiàn),因此常常采用的是二級(jí)保守結(jié)構(gòu)的公變分析,還可以用于功能三維RNA模塊的計(jì)算機(jī)模擬預(yù)測(cè)。

 

首先為了解密RNA二級(jí)結(jié)構(gòu),研究人員采用了一些高通量的實(shí)驗(yàn)方法,2011年麻省理工大學(xué)布羅德學(xué)院開發(fā)了一種高分辨率新技術(shù),可以瞄準(zhǔn)一個(gè)特定細(xì)胞,研究所有RNA的變化過(guò)程。通過(guò)在極短的時(shí)間間隔內(nèi)給RNA拍攝快照,并將這些照片連在一起,不僅能顯示出RNA的數(shù)量變化,還能看到其生命周期中短暫的中間過(guò)程。研究小組將這種追蹤新生RNA生命周期的技術(shù)與一種新的測(cè)序技術(shù)結(jié)合,就能計(jì)算出mRNA(信使RNA,攜帶遺傳信息,在蛋白質(zhì)合成時(shí)充當(dāng)模板)的數(shù)量。

 

這一新技術(shù)的一個(gè)關(guān)鍵應(yīng)用是跟蹤如癌癥或其他影響到RNA生命周期的疾病中的基因突變。過(guò)去人們只知道發(fā)生了突變,而要看到細(xì)胞里分子過(guò)程中所發(fā)生的突變結(jié)果卻非常困難。新技術(shù)能讓研究人員深入透視到細(xì)胞內(nèi)部,看到基因突變?nèi)绾螖_亂了RNA的數(shù)量水平,反過(guò)來(lái)又合成了哪種蛋白質(zhì)。