近日來自華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們利用強大的DNA測序技術(shù)不僅確定了一位癌癥患者的根源基因突變——被視為是個體化癌癥治療的關(guān)鍵，并且繪制了疾病的基因演變圖譜，監(jiān)控了對于治療的反應(yīng)。

上接：DNA測序為個體化癌癥治療奠定基礎(chǔ)（上）

利用基因組研究所開發(fā)的一項稱為“深度數(shù)字測序”（ deep digital sequencing）的技術(shù)，她們對患者腫瘤樣品中的個別突變進行了超過1000次的測序。從而提供了每位患者腫瘤基因組每種突變頻率的讀值，研究人員基于此繪制出了隨病情進展癌細胞的遺傳進化圖譜。

他們發(fā)現(xiàn)隨著癌癥發(fā)展，腫瘤獲得了一些新突變，然而卻始終保留著一些初始的突變?nèi)海鼈冊诩毎掳┳饔弥姓紦?jù)首要地位。這些研究發(fā)現(xiàn)表明如果能針對癌癥早期發(fā)生的遺傳變異，癌癥靶向藥物或可能更有效。而靶向僅存在于后期演變癌細胞中突變的藥物則有可能不會對疾病產(chǎn)生太大的效應(yīng)，因為它們無法殺死所有的腫瘤細胞。

Mardis認為測序癌細胞的完整基因組對拼湊癌細胞進化方式精確圖像而言是必不可少的。如果研究人員僅對涉及基因的小部分基因組測序，那他們就不具備隨時間追蹤突變頻率的統(tǒng)計能力（僅有1-2%的基因組包含基因）。

在另一項對絕經(jīng)后雌激素受體陽性乳腺癌婦女的III期臨床試驗研究中，華盛頓大學(xué)的研究人員證實測序可以幫助預(yù)測哪些婦女將對芳香酶抑制劑治療產(chǎn)生反應(yīng)。在手術(shù)前這些患者通常被給予降低雌激素的藥物。然而卻只有一半的雌激素受體陽性乳腺癌婦女對這些藥物產(chǎn)生反應(yīng)，醫(yī)生無法預(yù)測哪些患者將從中受益。

有趣的是，通過對芳香酶抑制劑治療前后的患者乳腺腫瘤進行測序，研究人員發(fā)現(xiàn)在反應(yīng)患者體內(nèi)發(fā)生了實質(zhì)性的基因組變化，而無應(yīng)答患者的基因組則并未通過治療發(fā)生顯著的改變。

“從未有人以這種分辨率水平來觀測治療反應(yīng)。誰正對治療產(chǎn)生應(yīng)答一目了然，”Mardis說。

此外，研究人員還在靶向缺陷蛋白的小分子抑制劑藥物對應(yīng)的乳腺腫瘤中鑒別出了一系列的突變。這些研究結(jié)果表明對于芳香酶抑制劑無應(yīng)答的婦女，治療方案或許應(yīng)聯(lián)合常規(guī)的化療和指定的小分子抑制劑。

Mardis 說：“我們認為其重要意義是表明對芳香酶抑制劑耐受的患者可能還有其他的治療選擇。隨著我們不斷地向前進展，我們認為測序?qū)⑻峁└嘀陵P(guān)重要的信息幫助確定患者最佳的治療方案?！?/SPAN>