近日來自華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院的科學(xué)家們利用強大的DNA測序技術(shù)不僅確定了一位癌癥患者的根源基因突變——被視為是個體化癌癥治療的關(guān)鍵，并且繪制了疾病的基因演變圖譜，監(jiān)控了對于治療的反應(yīng)。

華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院基因組研究所主任Elaine Mardis 說：“我們正通過測序腫瘤樣品尋找臨床相關(guān)的資料開展發(fā)現(xiàn)取向（discovery-oriented）的研究?；蚪M測試可在患者治療的多個時間點發(fā)揮功用，以鑒別腫瘤基因組中的‘驅(qū)動’突變，并確定攜帶這些突變的細胞是否已被治療清除?！?/SPAN>

Mardis在4月1日芝加哥召開的美國癌癥研究協(xié)會年度會議開幕式上表示這項研究正在幫助指導(dǎo)設(shè)計未來癌癥臨床試驗，在試驗中治療決策主要基于測序的結(jié)果。Mardis還是醫(yī)學(xué)院塞特癌癥中心（Siteman Cancer Center）和巴恩斯－猶太醫(yī)院（Barnes-Jewish Hospital）的成員。

迄今為止，Mardis和她的同事們已經(jīng)對來自700多名癌癥患者的腫瘤細胞進行了全基因組測序。通過比對癌癥患者腫瘤細胞與健康細胞的遺傳序列，她們可以找出每個患者腫瘤潛在的突變。

研究人員利用全基因組測序獲得的信息，根據(jù)腫瘤的基因組成而非腫瘤部位對其進行了重新分類。例如在乳腺癌患者中，Mardis及同事發(fā)現(xiàn)了大量驅(qū)動基因突變，而這些基因以前從未顯示與乳腺癌相關(guān)。

其中一些基因已被確定存在于前列腺癌、結(jié)腸癌、肺癌或皮膚癌，以及白血病和其他癌癥中。靶向這些基因突變的藥物，包括伊馬替尼（imatinib）、魯索利替尼（ruxolitinib）和舒尼替尼（sunitinib），雖尚未獲準(zhǔn)用于治療乳腺癌，但也都已經(jīng)上市用于治療其他癌癥。

“我們正在多種腫瘤類型中尋找已上市藥物可能潛在靶向的基因突變，”Mardis說。

Mardis認為腫瘤學(xué)家評估個體化癌癥治療的潛在利益還需要進行模式轉(zhuǎn)換。盡管臨床試驗通常涉及了隨機安排患者接受特定的治療方案，然而個體化醫(yī)療方法還需要基于每位患者腫瘤的潛在突變來選擇藥物。

Mardis承認：“可為每位患者提供的所有治療方案并不一定適合精心設(shè)計的臨床試驗。我們還需要更多的靈活性?！?/SPAN>

在癌癥過程中，基因突變的發(fā)展也可能對治療決策具重要的意義。在近期的一項研究中，Mardis和她的研究小組繪制了白血病的遺傳進化圖譜，發(fā)現(xiàn)的一些線索表明癌癥應(yīng)該靶向性針對疾病早期形成的突變。

下接：DNA測序為個體化癌癥治療奠定基礎(chǔ)（下）