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新方法可更好“拼寫檢查”基因序列

日期:2012-05-14 08:12:27

據(jù)報(bào)道,來(lái)自澳大利亞聯(lián)邦科學(xué)與工業(yè)研究組織和昆士蘭大學(xué)的研究人員發(fā)明了一種方法,可以更好地對(duì)基因序列進(jìn)行“拼寫檢查”。這將有助于生物學(xué)家更好地理解自然世界,相關(guān)研究論文發(fā)表在近期的《自然—方法學(xué)》上。

 

博士生Lauren Bragg等在Gene W Tyson帶領(lǐng)下,研發(fā)出一款軟件——Acacia。Bragg等用該軟件特別地檢查了微生物基因的重要部分——擴(kuò)增子。就像計(jì)算機(jī)的拼寫檢查程序查找單詞拼寫錯(cuò)誤一樣,Acacia發(fā)現(xiàn)了擴(kuò)增子在基因表達(dá)過(guò)程中出現(xiàn)的密碼子錯(cuò)誤。

 

Acacia較目前生物學(xué)家使用的兩款糾錯(cuò)工具具有明顯的優(yōu)勢(shì),并且更容易使用。

 

“此研究告訴國(guó)際生物界,現(xiàn)在有一款新軟件,可以快速、可靠地進(jìn)行基因序列糾錯(cuò)?!?/SPAN>Bragg說(shuō)。