《細(xì)胞》解析基因沉默的關(guān)鍵蛋白
日期:2012-05-29 08:25:03
來自冷泉港實(shí)驗(yàn)室,HHMI等處的研究人員發(fā)表了題為“The structure of human Argonaute-2 in complex with miR-20a”的文章,解析了一種結(jié)合在RNA上的人類蛋白三維原子結(jié)構(gòu),其上的這段RNA片段能“指導(dǎo)”蛋白沉默基因,這種蛋白就是有名的Ago2(Argonaute-2)蛋白,它在RNA干擾過程中扮演了一種關(guān)鍵的調(diào)控作用,這一重要成果公布在Cell雜志在線版上,目前可以免費(fèi)下載。
領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是冷泉港實(shí)驗(yàn)室結(jié)構(gòu)生物學(xué)家Leemor Joshua-Tor,這位女科學(xué)家在結(jié)構(gòu)生物學(xué)領(lǐng)域所獲成果頗豐,與清華大學(xué)施一公教授是同年選上HHMI研究員的。
對(duì)于這一成果,她表示,“關(guān)于人類Argonaute-2蛋白的結(jié)構(gòu),以及其與RNA向?qū)еg的相互作用的詳細(xì)信息,極大的促進(jìn)了我們對(duì)于這種蛋白生物學(xué)機(jī)制的理解”,“這些人類Argonaute與重要RNA結(jié)合的精確結(jié)構(gòu)信息,能助力基礎(chǔ)研究——理解基因的功能,以及促進(jìn)RNAi技術(shù)的發(fā)展——RNAi可以作為臨床應(yīng)用的一種治療策略?!?/SPAN>
細(xì)胞內(nèi)某個(gè)基因要發(fā)揮作用,需要其DNA首先拷貝成mRNA,然后這種轉(zhuǎn)錄信息利用細(xì)胞蛋白合成機(jī)器,翻譯成蛋白質(zhì),但是當(dāng)一個(gè)Argonaute-2蛋白結(jié)合到向?qū)?/SPAN>RNA小片段上的時(shí)候——這種RNA小片段有可能是短小的干擾RNA,或者是miRNAs,就會(huì)攔截mRNA分子。這種向?qū)?/SPAN>RNA能作為定位裝置,幫助Argonaute-2蛋白靶向mRNA。
幾年前,Joshua-Tor與冷泉港實(shí)驗(yàn)室等處的同事: Gregory Hannon合作,發(fā)現(xiàn)Argonaute蛋白是由不同結(jié)構(gòu)域部分組成的,就像是把分子剪刀,能沉默靶標(biāo)mRNA。他們分析的Argonaute蛋白來自一種能在極端高溫下生存的古細(xì)菌:Pyrococcus furiosus。
“但是我們還不了解其中Argonaute活性的生物學(xué)功能,以及機(jī)制”,Joshua-Tor說,“因此我們接下來聚焦于高等生物中這種蛋白的結(jié)構(gòu),比如哺乳動(dòng)物中的Argonaute蛋白,這些生物中Argonaute功能和靶標(biāo)確認(rèn)的相關(guān)信息,可以從文獻(xiàn)中獲取?!?/SPAN>
結(jié)果他們發(fā)現(xiàn),人類Argonaute-2蛋白總體結(jié)構(gòu)與結(jié)構(gòu)域組成,和古細(xì)菌中結(jié)構(gòu)相似,其中miRNA錨定在mid和PAZ結(jié)構(gòu)域末端,在結(jié)合槽(binding groove)中形成k轉(zhuǎn)折(k-turn)。而且這種miRNA的結(jié)合顯著提高了Argonaute-2蛋白的穩(wěn)定性,使其能保持穩(wěn)定的蛋白構(gòu)象。
研究人員推測(cè)向?qū)?/SPAN>RNAs指導(dǎo)的Argonaute-2蛋白活性,已經(jīng)進(jìn)化成最大形式的互惠,從而保證蛋白-RNA復(fù)合物長(zhǎng)期存在。這種長(zhǎng)期存在的特性對(duì)于許多生物學(xué)進(jìn)程來說十分重要。