肝細(xì)胞癌是最常見(jiàn)的肝臟腫瘤，在世界范圍內(nèi)腫瘤相關(guān)性死亡因素中排名第三，全球每年有超過(guò)50萬(wàn)新患者，中國(guó)新病例占了全球所有肝癌病例的一半以上（55%）。目前臨床上最主要治療肝癌的方法是手術(shù)切除和肝臟移植，經(jīng)肝動(dòng)脈栓塞的化療法則作為第二線治療。但是由于肝癌復(fù)發(fā)率高、且抗化療藥性強(qiáng)，整體治療效果并不理想。

在最新一期（5月27日）出版的《自然遺傳學(xué)》（Nature Genetics）上，分別由中日研究人員領(lǐng)導(dǎo)的兩個(gè)國(guó)際研究小組針對(duì)肝癌展開(kāi)了大規(guī)模的全基因組測(cè)序研究，這兩項(xiàng)成果分別是針對(duì)乙肝病毒整合機(jī)制和病因?qū)W對(duì)于肝癌相關(guān)基因突變模式及復(fù)發(fā)突變的影響。

在第一篇“Genome-wide survey of recurrent HBV integration in hepatocellular carcinoma”文章中，中國(guó)香港大學(xué)、新加坡國(guó)立大學(xué)和華大基因等機(jī)構(gòu)的研究人員對(duì)81例HBV陽(yáng)性和7例HBV陰性的肝細(xì)胞癌（HCCs）和鄰近正常組織進(jìn)行了大規(guī)模平行測(cè)序，結(jié)果發(fā)現(xiàn)HBV整合在肝癌中是一種普遍現(xiàn)象，相比于鄰近肝組織（30.7%），腫瘤中HBV整合的頻率要高得多（86.4%）。在HBV基因組中大約40%的HBV斷裂點(diǎn)位于HBV病毒增強(qiáng)子、X基因和核心基因定位的1800bp的區(qū)域內(nèi)。研究人員還發(fā)現(xiàn)了復(fù)發(fā)HBV整合事件，這一點(diǎn)通過(guò)RNA測(cè)序和Sanger測(cè)序在已知和推測(cè)癌癥相關(guān)TERT, MLL4 和 CCNE1基因上得到了驗(yàn)證。相比于正常組織，在腫瘤中這些基因的表達(dá)上調(diào)，表明這些基因可能在癌癥的發(fā)生過(guò)程中起著非常重要的作用。此外，研究人員還報(bào)道了表明一些HBV整合與患者生存相關(guān)的數(shù)據(jù)。

在第二篇“Whole-genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators”文章中，來(lái)自日本理化研究所的研究人員測(cè)序和分析了27個(gè)HCCs的全基因組，其中25個(gè)與乙型或丙型肝炎病毒感染相關(guān)，包括2組多中心性腫瘤。盡管在多中心腫瘤中未鑒別出共同的體細(xì)胞突變，研究結(jié)果表明它們的全基因組置換模式卻是相似的，這表明共有的的病因?qū)W背景有可能強(qiáng)有力影響了它們體細(xì)胞突變模式，但這些腫瘤是由來(lái)自獨(dú)立的突變形成的。統(tǒng)計(jì)學(xué)和功能分析生成了復(fù)發(fā)突變基因的列表。多個(gè)染色質(zhì)調(diào)控因子包括ARID1A, ARID1B, ARID2, MLL和MLL3在約50%的腫瘤中發(fā)生了突變。以高的克隆比例頻繁觀察到HBV基因組整合在TERT位點(diǎn)。此研究通過(guò)全基因組分析HCCs確定了病因?qū)W背景對(duì)于體細(xì)胞突變和隨后癌變以及對(duì)HCCs中染色質(zhì)調(diào)控因子復(fù)發(fā)性突變的影響。