今天來自傳染病結構基因組學中心（CSGID）和西雅圖傳染病結構基因組學中心（SSGCID）的研究人員宣布達到了流行病研究的一個重要里程碑，確定了來自傳染病生物體的1000種蛋白質的結構。來自這些結構的信息應該可以促成對這些病原體引起的致命性疾病的新干預。

自2007年以來，SSGCID，生物醫(yī)學研究所為首的Peter J. Myler博士和CSGID，西北大學范伯格醫(yī)學院分子藥理學和生物化學系Wayne Anderson博士獲得了來自美國國立衛(wèi)生研究院（NIH）下屬國立變態(tài)反應與感染性疾病研究所（NIAID）五年合同的資金資助。

來自兩個中心的研究人員利用X射線晶體學和核磁共振方法檢測了來自超過40種人類病原體的蛋白質的原子細節(jié)，其中包括鼠疫、炭疽熱、沙門氏菌病、霍亂、肺結核（TB）、麻風病、阿米巴痢疾和流感的病原體。這些蛋白質被選定是由于它們的生物醫(yī)學相關性，以及潛在的治療及診斷利益，有三分之一直接從傳染病研究團體處獲得。Anderson說：“我們?yōu)樗幬锇l(fā)現奠定了基礎。確定這些蛋白質的結構能夠幫助研究人員發(fā)現新藥、重要酶類和可能的候選疫苗的有潛力的靶點?！?/SPAN>Myler補充說：“兩個中心發(fā)布的超過80篇的科學論文凸顯了這一研究工作的重要性?！?/SPAN>

今天在醫(yī)學上的重要挑戰(zhàn)之一就是對抗產生了耐藥性的細菌?？辜籽跷髁纸瘘S色葡萄球菌（一般稱之為MRSA）由于對包含青霉素和頭孢菌素類等抗生素形成了耐藥性因此使治療變得極其困難。Anderson 說：“通過確定這些藥物靶向蛋白質的結構，我們現在能夠觀察到原子如何在空間內發(fā)生了重排以及它們如何相互作用。然后研究人員就可以確定細菌產生耐藥性的機制，找出改變藥物使細菌無法識別它的方法。”

SSGCID的聯合研究組長（PI）Lance Stewart博士說：“多重耐藥結核分枝桿菌(MDR-TB)菌株的出現也是全球一個重要的健康問題，來自印度的最新結核病例被認為具有廣泛的耐藥(XDR-TB)?！笔澜缧l(wèi)生組織（WHO）和其他的全球衛(wèi)生機構呼吁共同努力發(fā)現新的治療藥劑尋找新的更好的藥物對抗結核，尤其是靶向治療疾病耐藥性菌株的藥物。SSGCID已經解析了來自肺結核的22個蛋白質結構以及來自分枝桿菌屬的其他126個密切相關的靶點。這些分枝桿菌可以引起諸如麻風病、布路里潰瘍和艾滋病患者肺部感染等疾病。這些結構將有助于了解這些致命性疾病，并提供新藥開發(fā)的藍圖。

當這兩個結構基因組學中心最初獲得NIH資金時，他們的期望是在五年時間內解析750個結構。然而受到對這些病原體結構數據需求的驅動，他們已經超過了這一目標。技術的進步的兩個研究團隊的效率使得他們在5年合同期滿前遠遠超過了最初的目標。

Anderson說：“過去需要4年時間來確定一個結構?，F在我們可以每個星期確定大約3個。我們中心與超過200名科研合作者建立了交流，將大大加快藥物開發(fā)，了解這些生物體的生物學?！痹趦蓚€協(xié)會中的每個機構均對高通量流水線的不同方面做出了貢獻，包括利用生物信息學選擇靶蛋白，將基因克隆到細菌中生成蛋白，純化和結晶，利用美國和加拿大9種不同的光束線（beam-line）采集X射線衍射數據。在解析蛋白質結構后，研究團體可以通過NIH支持的蛋白質數據庫（Protein Data Bank）免費獲取索引。也可通過訪問CSGID和SSGCID網站獲取結構信息。

對指定蛋白質靶點結構測定感興趣的科學團體成員可以在SSGCID或CSGID網站上完成申請。這一服務免費提供給科學界，兩個中心還通過NIH資助的生物防衛(wèi)和新出現感染研究資源庫免費分發(fā)蛋白質表達克隆。