Nature重要成果:全基因組→癌癥標(biāo)記
日期:2012-06-12 11:51:41
由華盛頓大學(xué)圣路易斯分校(排名見(jiàn)2012全美最佳研究生院排名(醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究))領(lǐng)銜的研究團(tuán)隊(duì)發(fā)表了題為“Whole-genome analysis informs breast cancer response to aromatase inhibition”的文章,通過(guò)分析患有晚期乳腺癌患者的DNA序列,發(fā)現(xiàn)了不同癌癥的標(biāo)記,這將有助于預(yù)測(cè)雌激素降低治療的療效,并深入解析乳腺癌為何能快速增殖并擴(kuò)散。相關(guān)成果公布在Nature雜志上。
文章通訊作者,華盛頓大學(xué)醫(yī)學(xué)院基因組研究所主任Elaine Mardis 說(shuō),“這是首次利用癌癥基因組研究成果,分析未知癌癥突變,用以找到與治療療效和其它臨床特征相關(guān)的突變”,“如果這項(xiàng)研究成果在更大規(guī)模中得到了驗(yàn)證,那么我們認(rèn)為基因組信息就能成為臨床醫(yī)師,在多種治療方案中進(jìn)行選擇的一個(gè)重要數(shù)據(jù)?!?/SPAN>
乳腺癌是女性最常見(jiàn)的惡性腫瘤之一,這種疾病通常發(fā)生在乳房腺上皮組織,發(fā)病率占全身各種惡性腫瘤的7-10%,是一種嚴(yán)重影響婦女身心健康甚至危及生命的最常見(jiàn)惡性腫瘤之一。
這項(xiàng)研究選取了77位絕經(jīng)后,第二階段或第三階段雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌患者(此類(lèi)患者是最常見(jiàn)的乳腺癌形式),雌激素能刺激這些腫瘤的生長(zhǎng),因此這些女性患者需要接受芳香化酶抑制劑的治療,以降低體內(nèi)雌激素的含量。這些藥物能縮小乳腺癌腫瘤的大小,幫助許多女性免除了切乳手術(shù)。但是這種治療方法只在某些患者身上有效,對(duì)此醫(yī)生們并不了解其中的原因。
為了解答這一疑問(wèn),研究人員比對(duì)了患者腫瘤樣品,以及健康細(xì)胞中的DNA,從中試圖尋找只出現(xiàn)在癌細(xì)胞中的突變,利用這種方法,研究人員發(fā)現(xiàn)了患者癌細(xì)胞中的所有突變,而不僅僅是某些預(yù)期會(huì)出現(xiàn)的突變。
研究的腫瘤樣品來(lái)自?xún)身?xiàng)腫瘤樣品芳香化酶抑制劑臨床試驗(yàn)之一,研究人員收集了患者腫瘤的詳細(xì)信息,其中包括其是否對(duì)手術(shù)前,為期四個(gè)月的芳香化酶抑制劑治療作出應(yīng)答。其中29個(gè)腫瘤樣品來(lái)自對(duì)芳香化酶抑制劑治療發(fā)生抵抗的患者樣品,48個(gè)樣品來(lái)自作出反應(yīng)的患者腫瘤樣品。
研究人員發(fā)現(xiàn)對(duì)雌激素降低藥物作出應(yīng)答的腫瘤樣品,相對(duì)來(lái)說(shuō)突變較少,而那些抵抗治療的患者則突變率更高,基因組更加復(fù)雜。
研究人員在腫瘤樣品中發(fā)現(xiàn)了18個(gè)顯著的突變基因,這些基因比預(yù)期的更常發(fā)生改變,其中一些是已知的重要乳腺癌基因,但是還有一些是出乎意料之外的,比如參與白血病的基因。
為了分析這18個(gè)基因的臨床意義,研究人員擴(kuò)大了實(shí)驗(yàn)范圍,加入了另外的240位雌激素受體陽(yáng)性乳腺癌患者,她們對(duì)芳香化酶抑制劑治療也有相關(guān)記錄。
結(jié)果研究人員在許多患者癌癥中發(fā)現(xiàn)了幾個(gè)相對(duì)常見(jiàn),與治療應(yīng)答有關(guān)的基因——大約20%的腫瘤樣品發(fā)生了一種重要抑癌基因:TP53的突變,這些突變關(guān)系著芳香化酶抑制劑療效差,以及更易擴(kuò)散的快速擴(kuò)增腫瘤。帶有TP53突變的患者也更加容易患者一種稱(chēng)為luminal B的乳腺癌亞型,這種亞型預(yù)后效果差。
相反,出現(xiàn)在16%的患者中的另外一種突變:MAP3K1,以及其姊妹基因MAP2K4,則與芳香化酶抑制劑治療療效好相關(guān)聯(lián)。帶有這些基因的患者腫瘤生長(zhǎng)速度較慢,并且不會(huì)擴(kuò)散,常屬于luminal A乳腺癌,預(yù)后效果好。
還有一個(gè)稱(chēng)為GATA3的基因,也似乎與好的芳香化酶抑制劑治療療效有關(guān),而MALAT1,一個(gè)長(zhǎng)鏈非編碼RNA則指向不良療效。
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