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Science:基因組測序解密癌癥醫(yī)學(xué)之謎

日期:2012-08-27 08:03:12

大部分實驗性癌癥藥物未能進(jìn)入市場化的原因在于,這些藥物在早期臨床實驗中無法幫助到足夠多的實驗人群。但是即使藥物實驗“失敗”了,研究人員還是可以從中發(fā)現(xiàn)一部分患者腫瘤顯著縮小了。因為并不清楚為何有些患者有應(yīng)答,而大多數(shù)患者沒有療效,研究人員通常只能搖搖頭,繼續(xù)進(jìn)行研究。

 

然而來自紀(jì)念斯?。瓌P特琳癌癥中心的研究人員現(xiàn)在指出,通過對其中一個腫瘤反應(yīng)異常的患者進(jìn)行全基因組測序,就能了解為什么這位患者在接受實驗后,腫瘤會消退,而其他人沒有。這將有助于各種癌癥藥物實驗,對于臨床癌癥藥物篩選具有重要意義。相關(guān)成果公布在Science雜志上。

 

對此麻省總醫(yī)院癌癥研究員José Baselga評價道,“這是一項重要的成果”,不僅有助于解答那些令人費解的癌癥藥物臨床實驗結(jié)果帶給我們的謎題,而且也表明發(fā)現(xiàn)藥物敏感基因,需要更多的實驗,而不僅僅是檢測患者的一個腫瘤。Baselga說,“我們也許需要走得更深入一些”,對整個基因組進(jìn)行測序。

 

在紀(jì)念斯?。瓌P特琳癌癥中心進(jìn)行的一項臨床實驗,頗為令研究人員費解:一位患有轉(zhuǎn)移性膀胱癌的女性患者,在服用一種藥物后,腫瘤就消失了,這種藥物稱為everolimus(依維莫司片),用于治療那些采用了其它抗癌藥物后,病情仍然持續(xù)惡化的晚期腎癌患者。這一藥物的原理是靶向細(xì)胞生長一種作用蛋白 mTORC1。

 

在這項實驗中,大多數(shù)患者服用了依維莫司都沒有出現(xiàn)療效,因此這種藥物作為膀胱癌單一藥劑,并沒有通過試驗,然而上文提及的這位患者至今已經(jīng)癌癥治愈兩年半了,這是一個對于這種癌癥來說“前所未有,相當(dāng)漂亮的結(jié)果”,因為膀胱癌適合于化療,文章通訊作者之一,David Solit博士指出。

 

Solit的研究組檢測了這位女性患者腫瘤中 mTORC1途徑中一些基因的突變,希望能解釋這個腫瘤的敏感性,但是并未發(fā)現(xiàn)什么。因此他與來自加州大學(xué)舊金山分校的生物信息學(xué)家Barry Taylor實驗室展開了合作,同時Solit也將這位患者的一個腫瘤樣品寄給了一家商業(yè)實驗室,進(jìn)行全基因組測序。

 

通過比較腫瘤基因組與這位患者正常DNA序列,研究人員發(fā)現(xiàn)了兩個基因突變:NF2 TSC1,這兩個基因也是實驗室研究發(fā)現(xiàn)存在于mTORC1途徑中的基因。其中TSC1突變在其它幾個膀胱癌樣品中也出現(xiàn)了,不過NF2沒有。

 

雖然TSC1tuberous sclerosis complex 1)之前未發(fā)現(xiàn)過,但是這個基因的出現(xiàn)有些道理——生而帶有TSC1突變的人群之后會發(fā)展出良性腫瘤。因此研究人員在其它12個患者中也開始找尋TSC1突變,結(jié)果發(fā)現(xiàn)其中4為腫瘤縮小的患者也帶有TSC1突變,而剩下9位沒有應(yīng)答的患者,其中一位出現(xiàn)了這一變化。

 

Solit和其它研究人員計劃篩選帶有TSC1突變的膀胱癌患者,因此他們進(jìn)一步檢測依維莫司和其它幾種mTORC1靶向藥物,“現(xiàn)在我們有了一個明確的方向”,Solit說。并且他認(rèn)為這一方法也可以用去其它臨床實驗?!斑@就改變我們分析這些異常案例的方式”,雖然研究人員已經(jīng)知道某些癌癥藥物只能作用于腫瘤中特殊突變的患者,但是全基因組測序能幫助找到更多遺傳變化,他說。

 

特別關(guān)注