首次發(fā)現(xiàn)DNA非編碼區(qū)與癌癥風險強關聯(lián)
日期:2012-08-28 07:52:17
來自美國加州梅奧診所的研究人員發(fā)現(xiàn)體內(nèi)遺傳編碼序列中某個特殊位點攜帶了一個“G”,而不是“A”的人群,比正常人群患有某種類型腦癌的幾率,高出大約6倍。
這項研究是由遺傳學家Margaret Wrensch,John Wiencke教授等人完成,公布在8月26日Nature Genetics雜志上,這將能幫助研究人員確定某種亞型神經(jīng)膠質(zhì)瘤的患病風險,這種疾病每年在美國診斷出的23000例腦癌癥病例中占據(jù)約4600人。
基于這個發(fā)現(xiàn),科學家們已經(jīng)開始考慮進行有關臨床測試,只通過血液檢查,就能告訴腦掃描異常的患者,他們患有什么樣的腫瘤。
研究人員還需要了解這種特殊的DNA變化是如何引發(fā)腫瘤的,Wrensch說,因為“這是發(fā)現(xiàn)的第一例,DNA非編碼區(qū)域的改變與患癌風險緊密關聯(lián)。”
幾年前,當研究人員開始捕捉可能與膠質(zhì)瘤發(fā)展相關聯(lián)的基因組區(qū)域的時候,他們發(fā)現(xiàn)8號染色體中具有單核苷酸多態(tài)性SNPs的一個區(qū)域,與腦癌相關,之后Wrensch等人利用先進的基因組技術,搜尋導致腦癌形成的SNP。
他們發(fā)現(xiàn)了七個候選基因,其中有一個稱為rs55705857,這個基因之于膠質(zhì)瘤,正如BRCA1之于乳腺癌。
有趣的是, 這一地區(qū)僅通過最費力的方法:新一代測序方法才能被發(fā)現(xiàn),這說明實驗和數(shù)學的快捷方式可能會錯過這樣罕見的,高潛力的基因突變,作者說。
Wrensch等人發(fā)現(xiàn)帶有一種SNP——“G”,或者稱鳥嘌呤的患者神經(jīng)膠質(zhì)瘤發(fā)展緩慢,而帶有更常見的“A”腺嘌呤多態(tài)性的患者則相反。
“了解這種變異如何使患者腫瘤發(fā)展緩慢(還是致命的),非常重要”,Wrensch說?!斑@最終也許能發(fā)現(xiàn)扭轉這些腫瘤的進程,或阻止腫瘤形成的方法?!?/SPAN>
除此之外,研究人員還比較了這一基因變異在哺乳動物進化中的整個序列,發(fā)現(xiàn) 這一基因很保守,最早可以追溯到鴨嘴獸。研究人員還通過計算機建模,指出該區(qū)域也許編碼一段小分子RNA,一種能調(diào)控細胞內(nèi)遺傳信息活性的核苷酸。
這一模型發(fā)現(xiàn)SNP位于小分子RNA的功能區(qū)域,這表明從“A”到“G”的遺傳變化帶來了嚴重后果。該研究小組正在分析這種小分子RNA確實存在,其功能可能是什么。
“變化后的小分子RNA可能靶向抑癌基因,可能激致癌基因,也有可能會參與調(diào)節(jié)基因組的穩(wěn)定性,或者是這些都有,” John Wiencke說。 “現(xiàn)今基因組時代的最大挑戰(zhàn)之一,就是找到所有這些新的基因突變的功能?!?/SPAN>