Nature:基因也許不那么自私
日期:2012-10-19 07:53:22
地球的生命起源一直是個重大的不解之謎。一項新研究提出,初始化學物質轉化為生命物質是分子間相互協(xié)作的結果。從狼群狩獵,到細胞發(fā)揮功能,生命的各個層面都離不開協(xié)作。在17日Nature網(wǎng)站上發(fā)表的文章中,Vaidya等人展示了RNA裝配的自發(fā)性協(xié)作網(wǎng)絡,提出生命起源于分子間的自發(fā)協(xié)作。文章主要對三個RNA片段的協(xié)作環(huán)路進行了詳細描述,數(shù)據(jù)顯示可能還存在更大的協(xié)作網(wǎng)絡。
現(xiàn)代生物的分子構架有明確的分工:核酸分子DNA和RNA主要負責遺傳信息儲存和處理,蛋白則負責結構和代謝。而地球早期的原始生命缺乏DNA和蛋白,只依賴RNA進行遺傳和代謝。當時“RNA世界”的基石就是RNA分子的自我復制,這包括發(fā)生突變并向更有效的復制演化。
這些自我復制的RNA堪稱原始版的自私基因,它們又是如何在早期地球上出現(xiàn)的呢?近來已有研究展示了核苷酸累積并聚合成為短鏈RNA的過程,的確,即使是非常短的RNA也能執(zhí)行化學反應(RNA酶或者核酶)。但自我復制所需的核酶更長更復雜,這樣的核酶又是在何時以怎樣的形式產(chǎn)生的呢?這就陷入了先有雞還是先有蛋的悖論。
Vaidya及其同事所提出的策略,恰好能回答上述問題。這項研究的基礎是一個30年前提出的理論,該理論認為自我復制的RNA除了單純復制自身以外,還會通過超循環(huán)hypercycles對其他復制子起作用。研究人員發(fā)現(xiàn)固氮弧菌Azoarcus的核酶在被片段化后可以自我組裝。而且如果使這些RNA片段發(fā)生突變,那么突變片段不僅可以組裝,還會彼此作用形成協(xié)調的組裝環(huán)路,就像理論中的超循環(huán)一樣。
關鍵是,參與協(xié)作環(huán)路的RNA更有優(yōu)勢,使其能夠勝過單純的自我復制循環(huán)。研究顯示,協(xié)作可以使四個不同RNA片段裝配成為更長的核酶,即小RNA分子能夠通過協(xié)作形成長而復雜的RNA分子。
那么早期地球上的隨機RNA鏈是怎樣形成協(xié)作網(wǎng)絡的呢?在目前這項研究中,所有的RNA鏈都來自于固氮弧菌核酶的加工片段。這就引出了兩個問題,如果固氮弧菌核酶片段上的突變太多是否會影響到RNA的組裝,另外如果存在許多不相關甚至相互干擾的RNA片段能否依然形成RNA協(xié)作網(wǎng)絡。
地球生命起源的確切分子事件也許已經(jīng)遺失在歷史的長河中,不過科學能夠通過模擬再現(xiàn)古代分子,分析非生命物質向生命物質轉化的可能途徑。Vaidya及其同事的研究展現(xiàn)了生命起源時期的分子協(xié)作,這一機制告訴我們也許地球上的第一個基因并非那么自私。至于協(xié)作網(wǎng)絡如何產(chǎn)生,該網(wǎng)絡帶來的復雜性是否一定使復制更有效,這些問題還有待進一步的深入研究。
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