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Cell:miRNA,調(diào)控子的調(diào)控

日期:2012-11-13 08:14:25

MicroRNAs是多細(xì)胞生物體遺傳程序的重要調(diào)控者。由于它們具有強(qiáng)大的作用,其自身的生成也受到嚴(yán)密地控制。來(lái)自德國(guó)馬克思•普朗克發(fā)育生物學(xué)研究所的科學(xué)家們?cè)谛卵芯恐蝎@得了關(guān)鍵的研究發(fā)現(xiàn)。他們?cè)跀M南芥(阿拉伯芥,thale cress)中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)調(diào)節(jié)micro RNAs生成的新元件,通過(guò)去除一種micro RNA生物合成酶上的磷酸基團(tuán)來(lái)發(fā)揮作用。它有可能像開(kāi)關(guān)轉(zhuǎn)換一樣快速,使得植物能夠適應(yīng)不斷變化的環(huán)境。

 

在這項(xiàng)研究中,科學(xué)家們利用先進(jìn)的成像技術(shù)輕易地檢測(cè)到了有microRNA活性缺陷的植物,采用全基因組測(cè)序迅速鑒別出了新突變。研究發(fā)現(xiàn)在線發(fā)表在119日的《細(xì)胞》(Cell)雜志上。

 

細(xì)胞似乎阻礙了自身閱讀DNA,在這一過(guò)程中細(xì)胞核中的DNA轉(zhuǎn)錄生成移動(dòng)的mRNA,隨后mRNA被運(yùn)送到細(xì)胞質(zhì)中作為蛋白質(zhì)生成的藍(lán)圖。同時(shí),細(xì)胞生成micro RNAs,通過(guò)與特異的mRNA結(jié)合能夠阻斷蛋白質(zhì)生成或甚至啟動(dòng)破壞蛋白質(zhì)合成。但細(xì)胞為何要在啟動(dòng)一個(gè)如此費(fèi)力的過(guò)程后又立即終止它呢?論文的第一作者、馬克思•普朗克發(fā)育生物學(xué)研究所博士后Pablo Manavella 說(shuō):“嗯,答案在于細(xì)胞必須在蛋白質(zhì)生成和避免過(guò)量之間獲得一個(gè)微妙的平衡。一旦mRNA的轉(zhuǎn)錄被激活,它就會(huì)相當(dāng)?shù)姆€(wěn)定。如果你需要快速終止它,借助諸如micro RNAs等調(diào)控機(jī)制能夠攔截這一過(guò)程。“這一研究是與來(lái)自圖賓根大學(xué)植物分子生物學(xué)(ZMBP)中心和蛋白質(zhì)組中心的科學(xué)家們協(xié)作完成。

 

從前體生成micro RNAs,這一過(guò)程已經(jīng)被廣泛地展開(kāi)研究,尤其是在動(dòng)物細(xì)胞中?!爸参镏械?/SPAN>Micro RNAs的進(jìn)化平行且獨(dú)立。我們不得不假定它們是通過(guò)不同的方式進(jìn)行加工處理的,”Pablo Manavella解釋說(shuō)。

 

科學(xué)家們采用了一種系統(tǒng)性的方法研究了擬南芥細(xì)胞中micro RNAs的活性。首先,他們開(kāi)發(fā)了一個(gè)基于螢火蟲生物發(fā)光蛋白熒光素酶的報(bào)告系統(tǒng);將熒光素酶基因整合到植物細(xì)胞中。其次,科學(xué)家們將包含人造的能特異性抑制熒光素酶的micro RNA 前體的DNA片段插入到植物基因組中。盡管包含編碼熒光素酶的基因,這些植物最初并沒(méi)有發(fā)射光線。在一個(gè)大規(guī)模的實(shí)驗(yàn)中,科學(xué)家們?cè)诔汕先f(wàn)的植物中引發(fā)了非特異性的突變。借助一種特殊的高靈敏度相機(jī)將少數(shù)發(fā)光的植物挑選出來(lái)?!霸谒羞@些單個(gè)植物中,部分的micro RNA信號(hào)通路受損因此通過(guò)人造micro RNA不再能夠沉默熒光素酶,”Pablo Manavella說(shuō)。

 

為了確定導(dǎo)致熒光素酶沉默失敗的基因,科學(xué)家們利用了馬克思•普朗克研究所開(kāi)發(fā)的一種新技術(shù),借助于全基因組序列分析使得他們能夠快速檢測(cè)因果突變causal mutation)?!熬褪窃趲啄昵埃@一項(xiàng)目也很難在兩年之內(nèi)完成。而現(xiàn)在,全基因組測(cè)序成為了一種快速且廉價(jià)的方法。將熒光素酶活性篩查測(cè)試與全基因組測(cè)序相結(jié)合,我們能夠?qū)⒀芯康闹芷趶臄?shù)年縮短到幾個(gè)月,”Pablo Manavella解釋說(shuō)。在所獲得的突變中,科學(xué)家們確定了磷酸酶CPL1microRNA生物合成信號(hào)通路的一個(gè)關(guān)鍵元件。這一蛋白通過(guò)去除信號(hào)通路中的一個(gè)主要輔因子(co-factor )HYL1的磷酸殘基,破壞了micro RNAs生成。一旦生成這些micro RNAs,它們就會(huì)與對(duì)應(yīng)的mRNA結(jié)合,終止蛋白質(zhì)合成。

 

“我們確定了一個(gè)能夠調(diào)控這些調(diào)控子活性的因子,”Pablo Manavella概述他們的結(jié)果說(shuō)道。Micro RNAs只代表了許多遺傳調(diào)控機(jī)制其中的一種,然而以一種開(kāi)關(guān)的方式它們?yōu)槔缭谠S多發(fā)育過(guò)程中不斷改變的需求提供了快速高效的應(yīng)答。一般來(lái)說(shuō),植物中的micro RNAs比動(dòng)物中的更為特異,科學(xué)家們說(shuō):“當(dāng)面臨壓力情況時(shí),植物不能逃跑。因此,它們需要快速的途徑調(diào)控自身基因以適應(yīng)這樣的狀況?!?/SPAN>