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Nature:CRISPR系統(tǒng)的新功能

日期:2013-04-15 10:02:34

CRISPR(規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù))是細(xì)菌用來(lái)抵御病毒的一個(gè)基因系統(tǒng),該系統(tǒng)在基因工程領(lǐng)域的應(yīng)用潛力巨大,由此吸引了許多科學(xué)家的注意。而Emory大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),這一系統(tǒng)還能幫助細(xì)菌躲避哺乳動(dòng)物的免疫系統(tǒng),文章于四月十四日發(fā)表在Nature雜志上。

 

乳品行業(yè)的研究者們,希望能夠阻止噬菌體和病毒對(duì)奶酪/酸奶生產(chǎn)的影響,他們?cè)谘芯恐邪l(fā)現(xiàn)了作為細(xì)菌免疫系統(tǒng)的CRISPR。細(xì)菌能夠?qū)⑹删w的DNA片段整合到CRISPR區(qū)域,并利用這一信息抵御噬菌體的入侵。

 

現(xiàn)在,Emory大學(xué)醫(yī)學(xué)院和Emory疫苗中心的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),細(xì)菌Francisella novicida的傳染力依賴CRISPR系統(tǒng)。這種細(xì)菌是Tularemia致病菌和腦膜炎致病菌的近親。研究人員發(fā)現(xiàn),F. novicida在哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)生長(zhǎng)時(shí),會(huì)通過CRISPR系統(tǒng)關(guān)閉自身的一個(gè)基因,以避免被宿主免疫系統(tǒng)發(fā)現(xiàn)并摧毀。他們認(rèn)為,抑制CRISPR系統(tǒng)能夠使細(xì)菌在免疫系統(tǒng)面前顯形,這一發(fā)現(xiàn)有望加速相關(guān)疫苗的研發(fā)。

 

F. novicida主要感染嚙齒類,極少感染人類。這種細(xì)菌往往被用作研究F. tularensis的模型,而F. tularensis是潛在的生物武器。研究人員分離了CRISPR系統(tǒng)存在缺陷的F. novicida菌株,發(fā)現(xiàn)CRISPR系統(tǒng)中的一個(gè)蛋白對(duì)其毒力有重要影響?!霸撏蛔儗?duì)細(xì)菌的影響很大,”Emory大學(xué)醫(yī)學(xué)院的助理教授David Weiss說(shuō)?!耙吧?/SPAN>F. novicida會(huì)殺死小鼠,而突變型過幾天就被機(jī)體清除?!?/SPAN>

 

研究顯示,在細(xì)菌感染哺乳動(dòng)物細(xì)胞時(shí),需要一個(gè)CRISPR基因關(guān)閉脂蛋白的合成,脂蛋白是細(xì)菌細(xì)胞膜的組成成分。如果將宿主的免疫細(xì)胞比作大海中的鯊魚,那么對(duì)于它們來(lái)說(shuō),細(xì)菌脂蛋白就如同海水里的血一般充滿著吸引力。因此,為了不被免疫系統(tǒng)發(fā)現(xiàn),細(xì)菌就必須關(guān)閉脂蛋白的生產(chǎn)。文章的第一作者Tim SampsonWeiss一同解析了CRISPR系統(tǒng)關(guān)閉脂蛋白合成的機(jī)制。細(xì)菌的CRISPR系統(tǒng)包括蛋白編碼基因,和重復(fù)的噬菌體DNA片段。這些重復(fù)片段所生成的RNA,會(huì)引導(dǎo)Cas9酶對(duì)噬菌體DNA進(jìn)行切割。

 

研究人員發(fā)現(xiàn),F. novicidaCRISPR系統(tǒng)還會(huì)生成一種RNA,引導(dǎo)Cas9對(duì)脂蛋白基因進(jìn)行調(diào)節(jié)。Weiss指出,Cas9調(diào)節(jié)系統(tǒng)使F. novicida能夠在適當(dāng)?shù)臅r(shí)候有效下調(diào)脂蛋白?!俺饲懈钍删w基因以外,Cas9還能夠調(diào)節(jié)細(xì)菌基因,這是一項(xiàng)新發(fā)現(xiàn),”Sampson說(shuō)。

 

研究人員又與Emory大學(xué)的助理教授Yih-Ling Tzeng合作,對(duì)Cas9缺陷型腦膜炎奈瑟菌(Neisseria meningitidis)進(jìn)行研究,這種細(xì)菌會(huì)感染人體引發(fā)腦膜炎。研究顯示,Cas9的缺陷影響了這種細(xì)菌的入侵和復(fù)制能力,說(shuō)明在其他細(xì)菌中Cas9CRISPR也與感染能力有關(guān)。

 

“具有Cas9的細(xì)菌大多是致病菌或是人體內(nèi)的常見菌,”Sampson說(shuō)。“我們相信,在其他細(xì)菌與宿主的相互作用中,Cas9CRISPR系統(tǒng)也具有類似功能?!?/SPAN>