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Science:DNA上的漫步

日期:2013-04-23 09:19:53

科學(xué)家們對細菌的一種限制性內(nèi)切酶進行研究,揭示了解旋酶沿DNA做長距離移動的機制,展示了這種酶對ATP能源的高效利用,文章發(fā)表在本期Science雜志上。

 

解旋酶helicase是一類分布廣泛的三磷酸腺苷酶(ATPase),在基因組中具有重要的功能。人類中的一些癌癥就與細胞的解旋酶有關(guān)。德國Bristol大學(xué)和Dresden工業(yè)大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),解旋酶能夠?qū)⒒瘜W(xué)能和機械能巧妙的結(jié)合起來加以利用。這項研究深入解析了解旋酶的詳細作用機制,將有助于加深人們對解旋酶作用的了解,幫助研究者們開發(fā)新的相關(guān)技術(shù)和治療方法。

 

DNA解旋酶沿著DNA移動,并同時解開雙螺旋,露出單鏈DNA以便進行修復(fù)或復(fù)制。此前人們普遍認為,這一過程伴隨著化學(xué)能源ATP的消耗,并因此將解旋酶視為一種分子馬達。

 

在這項新研究中,Ralf Seidel及其團隊通過單分子熒光顯微鏡,觀察了EcoP15I限制性內(nèi)切酶在病毒(噬菌體)DNA上的移動。他們對解旋酶進行了熒光標(biāo)記,在伸展一個DNA分子的同時,對單個解旋酶的移動進行觀察。此外,研究人員還通過高分辨率的熒光光譜法,分析了上述過程中蛋白構(gòu)造的動態(tài)變化,以及ATP消耗的動力學(xué)情況。

 

令人驚訝的是,這種解旋酶只在反應(yīng)初期消耗ATP。研究顯示,解旋酶在與目標(biāo)位點結(jié)合時,水解ATP進行構(gòu)象改變。此后解旋酶在DNA上的長距離移動,僅由熱運動(thermal motion)驅(qū)使,這種熱運動是指與周圍水分子的碰撞。這樣的機制形成了典型的“隨機行走”(random walk)模式,即蛋白向前和向后移動的幾率相同。

 

“我們的研究指出,解旋酶使用ATP能源進行構(gòu)象改變,而不是用來解旋DNA。解旋酶在DNA上的長程移動,并不需要使用ATP能源。這種隨機移動發(fā)生得很快,比許多ATP驅(qū)動馬達更有效率。我們認為,解旋酶經(jīng)由這一高效節(jié)能的途徑沿著DNA移動,這一機制可能也參與了DNA修復(fù)等其它過程?!蔽恼碌馁Y深作者之一,生化教授Mark Szczelkun說。

 

特別關(guān)注