Nature:最大規(guī)模人類疾病測序研究
日期:2013-05-24 09:07:22
來自倫敦大學瑪麗女王學院的研究人員領(lǐng)導完成了迄今為止最大規(guī)模的人類疾病測序研究,調(diào)查了6種自身免疫疾病的遺傳基礎(chǔ)。研究結(jié)果發(fā)表在5月22日的《自然》(Nature)雜志上。
這6種疾病分別是自身免疫性甲狀腺病、乳糜瀉、克羅恩病、銀屑病、多發(fā)性硬化癥和1型糖尿病,目前對于這些疾病的確切病因并不清楚,人們認為是遺傳和環(huán)境因素的復雜組合作用所導致。已經(jīng)鑒別的遺傳變異只能解釋每種疾病部分的異質(zhì)性。到目前為止,所采用的技術(shù)通常鑒別出的都是只具微弱效應的群體常見變異。
在這項研究中,來自全球的科學家組成的一個研究小組利用高通量測序技術(shù),力圖在一個包括近42,000名個體(24,892名自身免疫性疾病患者和17,019名對照)的樣本中,鑒別出從前確認的25個風險基因的新變異,其中包括罕見變異和潛在高風險變異。
在一項“罕見變異綜合性全基因組關(guān)聯(lián)假說”中,人們提出風險基因中少量的罕見變異有可能是這些疾病異質(zhì)性的主要原因。
然而,Nature新研究表明,這些疾病的遺傳風險更有可能,與在群體中數(shù)百個常見的微弱效應變異的復雜組合有關(guān)。
作者估計,對于可通過常見變異進行解釋的疾病,這些風險基因中的罕見變異只大約導致了3%的異質(zhì)性。
該研究的領(lǐng)導者、倫敦大學瑪麗女王學院胃腸道遺傳學教授David van Heel說:“研究結(jié)果表明,這些自身免疫性疾病的風險并不歸因于少數(shù)的高風險遺傳變異,而是具有微弱效應的許多常見遺傳變異隨機選擇所導致?!?/SPAN>
“在每一種疾病中都有可能存在成百上千這樣的變異,遺傳風險有可能來自于遺傳自父母雙親的大量的這些變異。如果情況確是這樣的話,我們或許永遠也不可能準確預測個體罹患這些常見自身免疫性疾病的遺傳風險。不過新研究結(jié)果為我們提供了有關(guān)這些疾病的生物學基礎(chǔ)和相關(guān)信號通路的重要信息,有可能促使發(fā)現(xiàn)新的藥物靶點。
該研究利用高通量測序技術(shù),第一次證明了測序可以與基因分型芯片平臺一樣準確,可作為“金標準技術(shù)”用于基因分型。
論文的共同作者、Barts與倫敦醫(yī)學和牙醫(yī)學院副校長Richard Trembath說:“研究結(jié)果提示需對決定常見自身免疫性疾病形成風險的遺傳結(jié)構(gòu)進行重新評估,并將推動未來仔細評估除已知賦予了這些重要醫(yī)學疾病敏感性的區(qū)域之外的人類基因組區(qū)域?!?/SPAN>
上一篇: Nature子刊:維生素C的新功能