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Cell子刊揭示蛋白質(zhì)降解新分子機(jī)制

日期:2013-05-30 08:57:56

細(xì)胞通過(guò)一套復(fù)雜的系統(tǒng)來(lái)控制和清除有缺陷的、多余的蛋白,從而避免它們損傷機(jī)體?,F(xiàn)在,來(lái)自德國(guó)和以色列的研究人員發(fā)現(xiàn)了參與這一至關(guān)重要過(guò)程的某個(gè)酶的新功能。利用酵母細(xì)胞作為模式生物,研究人員證實(shí)特殊因子Cue1,不僅是蛋白質(zhì)降解裝置中一個(gè)組件的受體和激活子,還確保了給缺陷蛋白標(biāo)記上降解分子標(biāo)簽。

 

蛋白質(zhì)是生物體細(xì)胞中的分子機(jī)器。不同類(lèi)型的蛋白質(zhì)執(zhí)行著大量不同的功能:它們將物質(zhì)輸送到目的地,抵御病原體,確保細(xì)胞內(nèi)的化學(xué)反應(yīng)等等。許多的蛋白質(zhì)是在稱(chēng)作為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)(endoplasmic reticulum,ER)的細(xì)胞器中生成,隨后折疊,然后再被運(yùn)送至它們的目的地。

 

一些蛋白只是為某一特定的、有時(shí)間限制的效用所需,它們的目的一旦實(shí)現(xiàn)就必須將這些蛋白質(zhì)降解。并且錯(cuò)誤也常常會(huì)發(fā)生在蛋白質(zhì)生成和折疊的過(guò)程中。缺陷蛋白質(zhì)沒(méi)有功能,甚至可能損害生物體。由此,也必須將它們降解。

 

因此,細(xì)胞通過(guò)一套復(fù)雜的系統(tǒng)來(lái)處理這些有缺陷、多余的蛋白質(zhì)。在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)中,存在有一個(gè)稱(chēng)之為內(nèi)質(zhì)網(wǎng)相關(guān)蛋白降解(ER-associated degradation,ERAD)的特殊蛋白質(zhì)降解過(guò)程。這一系統(tǒng)包含有大量的酶,它們協(xié)同作用確保了給缺陷蛋白標(biāo)記上泛素分子。這一過(guò)程就稱(chēng)之為泛素化(ubiquitylation)。4-6個(gè)一連串的分子充當(dāng)了降解信號(hào)。標(biāo)記著這樣一條分子鏈的蛋白質(zhì)被運(yùn)送至蛋白酶體,在那里被分解。

 

這種泛素-蛋白酶體系統(tǒng)普遍存在于所有的真核細(xì)胞中。它是最復(fù)雜的細(xì)胞系統(tǒng)之一,可保護(hù)機(jī)體避免發(fā)生嚴(yán)重疾病。缺陷蛋白逃避這一系統(tǒng)會(huì)引發(fā)諸如阿爾茨海默氏癥、帕金森氏病、亨廷頓氏病、囊性纖維化或糖尿病等嚴(yán)重疾病。以色列理工學(xué)院的Aaron Ciechanover教授率先發(fā)現(xiàn)了這一保護(hù)性的程序,由于這一成果他與Avram Hershko教授以及Irwin Rose共同分享了2004年的諾貝爾化學(xué)獎(jiǎng)。

 

有幾種酶必須協(xié)同作用,才能促使將泛素鏈添加到缺陷蛋白上。其中一些酶錨定在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)的膜上,其他一些酶,例如Ub7則在細(xì)胞內(nèi)自由地游動(dòng)。一個(gè)稱(chēng)之為CUE1的因子,自身錨定在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上,負(fù)責(zé)招募Ubc7,將其護(hù)送到內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜上其他的酶處。為了做到這一點(diǎn),它通過(guò)一個(gè)結(jié)構(gòu)域來(lái)特異性結(jié)合Ub7。此外,這一因子另外還有一個(gè)稱(chēng)作為CUE的結(jié)構(gòu)域。德國(guó)Max Delbrück分子醫(yī)學(xué)中心的Katrin Bagola博士和Thomas Sommer教授,與以色列理工學(xué)院的Michael Glickman教授和Ciechanover教授,一同在酵母細(xì)胞中研究了CUE1的功能。

 

重要的聯(lián)結(jié)

 

CUE結(jié)構(gòu)域是一個(gè)泛素結(jié)合結(jié)構(gòu)域(ubiquitin-binding domain ,UBD)。UBDs與特定的泛素模式結(jié)合。例如,它們可以識(shí)別出是否有一個(gè)或是更多個(gè)的泛素分子添加到了蛋白上,各個(gè)泛素分子在泛素鏈中是如何連接到一起的。這種泛素模式?jīng)Q定了哪種泛素結(jié)構(gòu)域與哪些蛋白質(zhì)結(jié)合,由此決定了蛋白質(zhì)隨后的命運(yùn)。

 

直接影響分子鏈的形成——蛋白質(zhì)降解信號(hào)

 

德國(guó)Max Delbrück分子醫(yī)學(xué)中心的和以色列理工學(xué)院的研究人員多年來(lái)一直開(kāi)展緊密的合作,他們證實(shí)Cue1因子的CUE結(jié)構(gòu)域結(jié)合到了泛素鏈上。這些泛素鏈?zhǔn)菃蝹€(gè)的泛素分子通過(guò)特殊的組件而連接到一起,它們隨后充當(dāng)了蛋白質(zhì)的降解信號(hào)。此外,研究人員發(fā)現(xiàn),CUE結(jié)構(gòu)域還直接影響了泛素鏈的長(zhǎng)度:如果缺失CUE結(jié)構(gòu)域,或是突變導(dǎo)致功能受限,泛素鏈的形成速度會(huì)減慢,長(zhǎng)度變短。顯然,CUE結(jié)構(gòu)域穩(wěn)定了這一泛素鏈,使得其他的泛素分子能夠更容易被添加上。

 

在酵母細(xì)胞中,研究人員發(fā)現(xiàn)Cue1CUE結(jié)構(gòu)域以這樣的方式,實(shí)際上影響了ERAD系統(tǒng)降解蛋白質(zhì)的效率。研究人員懷疑,CUE結(jié)構(gòu)域有可能特異性地用于處理與內(nèi)質(zhì)網(wǎng)膜結(jié)合的蛋白。它們似乎對(duì)于可溶性蛋白質(zhì)的降解沒(méi)有影響。“我們的研究結(jié)果表明,泛素結(jié)合域還可能調(diào)控了泛素鏈的形成。直到現(xiàn)在,我們才了解這一從前未知的功能,”研究人員說(shuō)。