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Nature新文章:生命起源于“RNA世界”

日期:2013-11-07 09:07:42

來自芝加哥大學(xué)的科學(xué)家們在《自然》(Nature)雜志上報告稱,RNA是控制基因表達(dá)的分子機(jī)器——剪接體的重要功能元件。這一研究發(fā)現(xiàn)確立了是RNA,而非蛋白質(zhì),負(fù)責(zé)催化了這一基礎(chǔ)生物學(xué)過程,豐富了地球上的生命起源于僅以RNA為基礎(chǔ)的世界這一假說。

 

研究的共同通訊作者、芝加哥大學(xué)分子遺傳學(xué)和細(xì)胞生物學(xué)副教授Jonathan Staley博士說:“真核基因表達(dá)的三個重要過程,其中有兩個——剪接和翻譯現(xiàn)在被證實是由RNA催化。真核基因表達(dá)信號通路與其說是一條基于蛋白質(zhì)的信號通路,不如說是一條基于RNA的信號通路。”

 

為了實現(xiàn)基因表達(dá),必須將DNA翻譯為蛋白質(zhì),這些結(jié)構(gòu)和功能分子催化了生命所需的化學(xué)反應(yīng)。為此,儲存在DNA中的遺傳信息首先會被復(fù)制到信使RNA (mRNA)鏈中,隨后這些mRNA被用于制造蛋白質(zhì)。

 

在真核生物中,幾乎所有的基因都進(jìn)行選擇性剪接mRNA前體按許多不同的組合進(jìn)行切割再連接到一起。這顯著地增加了單個基因編碼的蛋白質(zhì)數(shù)量,被認(rèn)為是導(dǎo)致高等生物體大量復(fù)雜性的原因。剪接是一個至關(guān)重要的生物學(xué)機(jī)制——至少15%的人類疾病是由于剪接錯誤所致。

 

剪接體是由蛋白質(zhì)和短非編碼RNA片段構(gòu)成,其通過催化作用來完成剪接。在生物過程中催化作用通常被認(rèn)為是以蛋白質(zhì)為基礎(chǔ)的酶所為。然而,以往的研究則提示對之負(fù)責(zé)的有可能是剪接體中的RNA。盡管經(jīng)歷了數(shù)十年的研究,到目前為止這一問題仍未獲得答案。

 

為了解答這一問題,Staley和芝加哥大學(xué)生物化學(xué)、分子生物學(xué)和化學(xué)教授Joseph Piccirilli,與論文的共同主要作者、研究生Sebastian FicaNicole Tuttle展開了合作。

 

研究人員首先使得剪接體喪失了自我糾正剪接錯誤的能力。隨后他們改變了剪接過程中已知被切割的mRNA前體位點上的單個原子,以及被猜測對催化作用極其重要的剪接體RNA亞基——U6上的幾個原子。其中的一些改變導(dǎo)致了剪接不力。他們仔細(xì)檢測并系統(tǒng)解救了這一功能喪失,調(diào)查了個別及組合位點。由此探究了對于剪接功能至關(guān)重要的位點,確定了U6mRNA前體之間的聯(lián)系。

 

研究小組發(fā)現(xiàn),U6 RNA亞基直接控制了催化功能——有效地發(fā)揮了剪接體的刀片作用。這是第一個實驗證據(jù)證明,RNA是這一關(guān)鍵生物機(jī)制的重要功能組件。

 

他們還發(fā)現(xiàn)剪接體RNAsII型內(nèi)含子(一種進(jìn)化上古老的自剪接、催化RNA類型,存在于生命的所有主要分支中)在結(jié)構(gòu)和功能上存在顯著的相似之處。他們認(rèn)為這表明了這兩種以RNA為基礎(chǔ)的剪接催化因子共享了共同的進(jìn)化起源,提供了進(jìn)一步的證據(jù)表明,包括剪接體和核糖體在內(nèi)的重要現(xiàn)代RNA-蛋白質(zhì)復(fù)合體都從RNA世界進(jìn)化而來。

 

Piccirilli說:“在現(xiàn)代生命中,蛋白質(zhì)酶催化了大多數(shù)的生物反應(yīng)。這一研究結(jié)果發(fā)現(xiàn)像剪接體這樣的,蛋白質(zhì)組成多于RNA的系統(tǒng)利用了RNA進(jìn)行催化作用,其分子祖先完全是由RNA構(gòu)成,表明剪接體的反應(yīng)中心有可能是來自‘RNA世界’的一個分子化石?!?SPAN lang=EN-US>

 

特別關(guān)注