巴塞羅那基因組調(diào)控中心Dr. Roderic Guigó領(lǐng)導(dǎo)研究團(tuán)隊(duì)，對慢性淋巴細(xì)胞白血病進(jìn)行了轉(zhuǎn)錄組分析，獲得了CLL相關(guān)基因和突變的功能圖譜。這項(xiàng)工作發(fā)表在Genome Research雜志上。

這一項(xiàng)目是西班牙慢性淋巴細(xì)胞白血病基因組聯(lián)盟的最新成果，該聯(lián)盟曾鑒定了涉及CLL發(fā)展的主要突變，但當(dāng)時他們還不清楚這些突變的功能。

白血病是一種造血系統(tǒng)的惡性腫瘤，俗稱“血癌”，是最常見的惡性腫瘤之一。白血病按細(xì)胞分化程度可分為急性和慢性兩大類。根據(jù)受累的細(xì)胞類型，又可以分為粒細(xì)胞、單核細(xì)胞、淋巴細(xì)胞白血病等。其中慢性粒細(xì)胞性白血?。?/span>CML）占13%，急性粒細(xì)胞性白血?。?/span>AML）占28%，慢性淋巴細(xì)胞白血病（CLL）占30%，急性淋巴細(xì)胞白血病（ALL）占13%，其他不典型的占17%。

慢性淋巴細(xì)胞白血病CLL起病緩慢，在這種疾病中一些免疫功能不全的淋巴細(xì)胞發(fā)生了惡性的增生。CLL在歐美白種人中比較常見，患者的發(fā)病年齡大多在50歲以上，30歲以下的患者很少見。這種疾病的主要表現(xiàn)是全身淋巴結(jié)腫大，脾大，貧血及外周血中淋巴細(xì)胞異常增多。

CLL的臨床和生物學(xué)表現(xiàn)差異很大。全基因組測序或全外顯子組測序可以為人們揭示CLL中的主要突變，而RNA測序能為人們展示CLL的轉(zhuǎn)錄譜。在這項(xiàng)研究中，研究人員對98名患者的白血病細(xì)胞和健康B淋巴細(xì)胞，進(jìn)行了深度RNA測序。

他們發(fā)現(xiàn)在CLL和正常B細(xì)胞之間，有數(shù)千個轉(zhuǎn)錄元件發(fā)生了差異性的表達(dá)，其中包括蛋白編碼基因、非編碼RNA和假基因。轉(zhuǎn)座元件在CLL中全面擺脫了細(xì)胞對它們的束縛。此外，有兩千個基因表現(xiàn)出CLL特異性的剪切模式。研究顯示，CLL中涉及代謝通路的基因得到了更高水平的表達(dá)，而剪切體、蛋白酶體和核糖體相關(guān)基因被明顯下調(diào)。

在此基礎(chǔ)上研究人員將CLL患者分為兩個亞類，一組在較長時間之內(nèi)不需要治療，而另一組則需要迅速進(jìn)行治療。進(jìn)一步分析顯示，這兩組患者之間的差異，來自于淋巴結(jié)微環(huán)境中的B細(xì)胞受體激活。

“我們在對基因組進(jìn)行功能性分析的基礎(chǔ)上，區(qū)分了兩個不同的CLL患者群體。在這兩組患者之間CLL的侵襲性差異很大。理解這種差異背后的分子機(jī)制，可以幫助人們?yōu)?/span>CLL患者提供更個性化的治療，”Dr. Guigó說。