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Nature驚人發(fā)現(xiàn):RNA,修復(fù)損傷的模板

日期:2014-09-04 09:09:15

 

能夠準確地修復(fù)自發(fā)的錯誤、氧化或誘變劑導(dǎo)致的DNA損傷對于細胞生存至關(guān)重要。這種修復(fù)通常是利用完全相同或同源的完整DNA序列來實現(xiàn)。但科學(xué)家們現(xiàn)在證實,在一種常見芽殖酵母細胞內(nèi)RNA可充當模板用來修復(fù)破壞性最大的DNA損傷——DNA雙鏈斷裂

 

盡管較早的研究表明了將RNA寡核苷酸導(dǎo)入到細胞中可幫助修復(fù)DNA斷裂,新研究第一次證實了可利用細胞自身的RNA來實現(xiàn)DNA重組和修復(fù)。這一研究發(fā)現(xiàn)有助于更好地了解細胞維持基因組穩(wěn)定性的機制,如果將這一現(xiàn)象延伸至人類細胞,有可能促成針對遺傳疾病的新的治療或干預(yù)策略。

 

這項研究得到了美國國家科學(xué)基金會、國立衛(wèi)生研究所和喬治亞科學(xué)聯(lián)盟(Georgia Research Alliance)的支持。研究結(jié)果發(fā)表在93日的《自然》(Nature)雜志上。

 

論文的資深作者、喬治亞理工學(xué)院生物學(xué)院副教授Francesca Storici說:“我們證實了遺傳信息可以一種同源驅(qū)動的方式從RNA流向DNA,從細胞的RNA流向同源的DNA序列。這一過程是在與遺傳信息通常流動相反的方向上移動它。我們證實了,當內(nèi)源性的RNA分子能夠經(jīng)退火與斷裂的同源DNA結(jié)合而不被移除時,RNA就可以修復(fù)受損的DNA。這一研究發(fā)現(xiàn)揭示了一種新的遺傳重組機制。“

 

大多數(shù)新轉(zhuǎn)錄的RNA都會從細胞核快速進入到細胞質(zhì),在基因編碼和表達以及細胞運作調(diào)控中發(fā)揮許多重要的作用。通常情況下,RNA遠離核DNA。事實上,眾所周知RNA退火后與互補染色體DNA結(jié)合對于細胞是危險的,因為它會損害轉(zhuǎn)錄延伸和DNA復(fù)制,促進基因組不穩(wěn)定。

 

這項新研究揭示出在基因毒應(yīng)激狀態(tài)下,例如DNA斷裂,RNA與互補DNA配對的作用有可能不同,對細胞是有益的。“我們發(fā)現(xiàn)了轉(zhuǎn)錄RNA經(jīng)退火與互補斷裂DNA結(jié)合,充當模板實現(xiàn)重組和DNA修復(fù),由此在改變和穩(wěn)定基因組中起作用的一個機制,”Storici說。

 

細胞內(nèi)外的各種原因都可導(dǎo)致DNA損傷。由于DNA是由兩條互補鏈構(gòu)成,一條DNA鏈通常用來修復(fù)另一條DNA鏈的損傷。但如果細胞遭受了雙鏈DNA斷裂,修復(fù)選項則更為受限。簡單地重新連接斷裂端具有很高的風險生成有害突變或染色體重排,可導(dǎo)致包括癌癥在內(nèi)的不良效應(yīng)。不能進行成功地修復(fù),細胞有可能會死亡或是無法執(zhí)行一些重要的功能。

 

2007年初,Storici研究小組證實將合成RNA導(dǎo)入到細胞中(包括人類細胞)可以修復(fù)DNA損傷,但這一過程是低效的,且研究人員對于這一過程可否自然地發(fā)生存在一些質(zhì)疑。

 

為了弄清楚細胞是否利用了內(nèi)源性的RNA轉(zhuǎn)錄物來修復(fù)DNA損傷,她和研究生Havva Keskin(第一作者)、Ying Shen(第二作者)利用釀酒酵母設(shè)計了一些實驗。研究人員開發(fā)了一種策略在芽殖酵母中區(qū)分內(nèi)源性RNA介和通常的DNA機制導(dǎo)的修復(fù)。他們隨后誘導(dǎo)酵母基因組發(fā)生了DNA雙鏈斷裂,觀察了這一生物是否能利用細胞中僅有的轉(zhuǎn)錄RNA來修復(fù)損傷,從而生存下來并生長。

 

Keskin說,研究人員構(gòu)建出了生成轉(zhuǎn)錄物的DNA區(qū)域,包含的一個標記基因中具有一個內(nèi)含子。在移除內(nèi)含子后,轉(zhuǎn)錄RNA序列中沒有內(nèi)含子,而生成轉(zhuǎn)錄物的DNA區(qū)域中則保有這一內(nèi)含子;因此它們是有差別的。他們發(fā)現(xiàn),只有以缺乏內(nèi)含子的轉(zhuǎn)錄物作為修復(fù)模板可以讓誘導(dǎo)DNA雙鏈斷裂的同源標記基因恢復(fù)功能。

 

研究人員對培養(yǎng)皿中的酵母菌落數(shù)進行了計數(shù),證實內(nèi)源RNA導(dǎo)致了修復(fù)。他們針對兩種斷裂形式進行了測試,一種是生成這一RNA轉(zhuǎn)錄物的DNA,另一種是來自DNA不同位點的同源序列。

 

研究人員發(fā)現(xiàn)RNA近似斷裂DNA可以提高修復(fù)效率,修復(fù)是通過一種同源重組過程來實現(xiàn)。Storici認為這種修復(fù)機制有可能在除酵母以外的細胞中起作用,有許多類型的RNA可被利用。

 

“我們證實遺傳信息從RNA流向DNA并不僅限于反轉(zhuǎn)錄因子和端粒,還發(fā)生在通用的細胞轉(zhuǎn)錄物身上,使得它成為了一種比預(yù)期更為普遍的現(xiàn)象。有可能,細胞中所有的RNA都具有這種功能。”

 

在未來,Storici希望能夠更多地了解這一機制,包括什么對它進行了調(diào)控。她還想知道這一機制是否發(fā)生于人類細胞之中。如果確是如此,有可能對于治療或預(yù)防遺傳損傷引起的一些疾病具有重要意義。

 

Storici 說:“在它們的生命周期里,細胞合成了很多的RNA轉(zhuǎn)錄物;因此,RNA有可能對于基因組穩(wěn)定性和可塑性造成了意想不到的影響。我們需要了解在什么情況下細胞或激活RNA-DNA重組。更好地了解這一分子過程,還有可能幫助我們操控一些機制,使得我們能夠治療或預(yù)防一種疾病。”

 

特別關(guān)注