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Cell重要發(fā)現(xiàn):人體就是一個(gè)“煉丹爐”

日期:2014-09-15 09:01:01

 

加州大學(xué)舊金山分校的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn),我們體內(nèi)生活的細(xì)菌可以生產(chǎn)大量的藥用分子,為新藥開(kāi)發(fā)提供了異常豐富的資源。這項(xiàng)研究發(fā)表在九月十一日的Cell雜志上。

 

人體內(nèi)共生的微生物能夠生產(chǎn)天然藥物,這些藥物對(duì)維持人體健康起到了重要的作用,文章的資深作者UCSF助理教授Michael Fischbach說(shuō)。

 

“現(xiàn)在市面上的藥物都是制藥公司生產(chǎn)的,但我們現(xiàn)在知道,人體菌群也能生成同樣有效的藥物分子,”Fischbach說(shuō)。

 

Fischbach介紹到,目前臨床上三分之一的藥物來(lái)自于微生物和植物,包括青霉素等抗生素、化療藥物和降膽固醇的藥物。人們不斷在土壤和海洋微生物中挖掘新藥,卻從未意識(shí)到我們自己就是一個(gè)“煉丹爐”。

 

人類微生物組計(jì)劃一直在研究常駐在人體各處的不同菌群,解析微生物多樣性和豐度與疾病之間的聯(lián)系。實(shí)際上,這些細(xì)菌合成的小分子也很重要,它們控制著細(xì)菌和宿主之間的互作,只可惜這類研究還沒(méi)有跟上進(jìn)度。

 

Fischbach等人開(kāi)發(fā)了數(shù)據(jù)分析軟件ClusterFinder,依據(jù)土壤和海洋微生物的生物合成基因簇(BGC),系統(tǒng)分析了人類微生物組計(jì)劃的遺傳學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)。他們?cè)谌梭w不同位置的菌群中,鑒定了3,118個(gè)生物合成基因簇。這些基因簇編碼的酶,可以合成類似現(xiàn)有藥物的分子。

 

研究顯示,在人體菌群的基因組和宏基因組中,廣泛存在著編碼硫肽類抗生素(thiopeptide)的BGC。研究人員純化了共生菌Lactobacillus gasseri生產(chǎn)的硫肽,將其命名為lactocillin,并且解析了它的結(jié)構(gòu)。他們發(fā)現(xiàn),lactocillin的結(jié)構(gòu)與一些已經(jīng)通過(guò)臨床試驗(yàn)的抗生素很相似,能殺死一些革蘭氏陽(yáng)性致病菌,同時(shí)又無(wú)損于那些無(wú)害的細(xì)菌。宏轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)表明,lactocillin等硫肽BGC的確在體內(nèi)得到了表達(dá)。

 

這項(xiàng)研究告訴我們,人類微生組中廣泛存在著編碼小分子的BGC。這些與人類共生的細(xì)菌,能在我們體內(nèi)生產(chǎn)大量類似藥物的小分子。

 

“我們需要了解這些分子是什么,有什么功能,”Fischbach說(shuō)。“這將為新藥開(kāi)發(fā)提供的非常誘人的資源。”此外,人們也可以在此基礎(chǔ)上,從分子水平研究微生物組對(duì)人體的影響。