科研就像賽跑,你比別人跑的快,就比別人多發(fā)幾篇SCI~
前兩期,給朋友們帶來了
做了很久的WB,走了很多彎路,但是WB想要做好并不難,總結WB實驗中可能會遇到的問題,分析可能的原因及對應的解決方案,才是實驗成功的基石。
蛋白免疫印跡(WB)是基于抗原抗體的特異性結合作用,以檢測復雜樣品中的某種蛋白,并對其進行半定量分析的一種方法。
主要用于靶標蛋白特異性表達的定性或半定量分析,蛋白與蛋白或蛋白與DNA相互作用的后續(xù)分析,以及蛋白修飾的鑒定分析。
1.為什么我的細胞提取液中沒有檢測到目的蛋白?
原因有很多:
a) 細胞中不表達這種蛋白質,換一種細胞;
b) 細胞中的蛋白質被降解掉了,可加入蛋白酶抑制劑,抑制蛋白酶活性;
c) 抗體不能識別目標蛋白,多看看說明,是否有問題;
d) 酶降解可能是沒有保持低溫操作,樣品保存不當,樣品放置時間過長。
2.我做的蛋白質分子量很?。?0 kDa),請問怎么做WB?
a)可以選擇PSQ膜,同時縮短轉移時間。也可以將兩張膜疊在一起,再轉移。其他按步驟即可;
b)也可選擇孔徑0.22 μm的PVDF膜或者NC膜,轉膜時間縮短,另外可采用Tricine-SDS-PAGE體系。
3.我的目的帶很弱,如何加強?
a)可以加大抗原上樣量,這是最主要的;
b)也可以將一抗稀釋比例降低;
c)還可以延長曝光時間。
4.DAB好還是ECL好?
DAB 有毒,但是比較靈敏,是HRP 最敏感的底物;
ECL結果容易控制,但被催化時靈敏度差一點,但如果達到閥值,就特別靈敏,可以檢測pg 級抗原。
5.膠片是一片空白,是怎么回事?
如果能夠排除下面的幾個問題那么問題多半出現(xiàn)在一抗和抗原制備上。
a) 二抗的HRP 活性太強,將底物消耗光;
b) ECM底物中H2O2,不穩(wěn)定,失活;
c) ECL底物沒覆蓋到相應位置;
d) 一抗選擇不當二抗失活;
e) 二抗失活。
6.磷酸化抗體的檢測樣本制備時是否一定要加NaF等?
NaF是一種廣譜磷酸化酶的抑制劑,一般最好加。但是不加也可以,大部分時候是不用加的。
7.細胞水平要做WB,多少細胞提的蛋白夠做WB?
一般5×10^6就足夠。
8.如果上樣量超載,要用什么方法來增加上樣量?
可以濃縮樣品,也可以根據(jù)目標分子量透析掉一部分小分子蛋白。一般地,超載30%是不會有問題的。如果已經(jīng)超了不少了,而且小分子量的也要,可以考慮加大膠的厚度,可以試試1.5 mm的。
9.大分子量蛋白200 kDa,在做WB要注意什么?
a) 做200kDa蛋白的WB時要注意,分離膠最好選擇>7%的;剝膠時要小心;
b) 轉移時間需要相應延長;要做分子量參照(否則出現(xiàn)雜帶不知道如何分析)。
c) 轉膜液中甲醇含量可適當降低,推薦使用濕裝轉膜效率更高哦!
10.免疫組化和WB可以用同一種抗體嗎?
免疫組化時抗體識別的是未經(jīng)變性處理的抗原決定簇(又稱表位),有些表位是線性的,而有的屬于構象型;線性表位不受蛋白變性的影響,天然蛋白和煮后的蛋白都含有;構象型表位由于受蛋白空間結構限制,煮后變性會消失。如果所用的抗體識別的是蛋白上連續(xù)的幾個氨基酸,也就是線性表位,那么這種抗體可同時用于免疫組化和WB,而如果抗體識別構象形表位,則只能用于免疫組化。
11.WB中抗體的可以重復應用嗎?
抗體工作溶液一般不主張儲存反復使用,但是如抗體比較珍貴,可反復使用2-3次。稀釋后應在2-3天內(nèi)使用,4℃保存,避免反復凍融。
12.上下槽緩沖液有何要求,怎樣才能達到最佳效果?
無特殊要求。但一般是上槽放新鮮的緩沖液,下槽可以是重復使用過一兩次的緩沖液。
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1.蛋白樣品準備
2.蛋白定量
3.上樣
4.凝膠電泳
5.轉膜
6.封閉
7.孵育一抗
8.孵育二抗
9.顯影
10.常見問題
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