Cell子刊:不容忽視的mRNA損傷
日期:2014-11-17 09:25:38
DNA損傷對(duì)所有細(xì)胞來(lái)說(shuō)都是一個(gè)大問(wèn)題,如果沒有得到及時(shí)修復(fù)就可能引發(fā)癌癥。實(shí)際上,傷害DNA的東西也同樣會(huì)傷害mRNA,但mRNA損傷并沒有引起人們的注意。
“所有人都覺得沒必要去管mRNA,因?yàn)檫@些分子周轉(zhuǎn)率很高很快就會(huì)降解,就算受點(diǎn)損傷也沒什么關(guān)系,”華盛頓大學(xué)的助理教授Hani Zaher說(shuō)。
“對(duì)大腸桿菌或酵母來(lái)說(shuō)可能是這么回事,”Zaher說(shuō)。“但在神經(jīng)元中就完全不同了,在某些情況下mRNA可能存在好幾天。如果它們受到損就會(huì)出現(xiàn)大問(wèn)題。”
“很明顯RNA損傷與神經(jīng)退行性疾病有關(guān),比如阿爾茨海默癥和ALS,”Zaher實(shí)驗(yàn)室的Carrie Simms博士說(shuō)。氧化壓力是阿爾茨海默癥的標(biāo)志之一,有研究顯示,晚期阿爾茨海默癥患者的神經(jīng)元中,有半數(shù)RNA分子被氧化。
Zaher、Simms等人在十一月十三日的Cell Reports雜志上發(fā)表文章指出,氧化的mRNA會(huì)堵塞核糖體,讓核糖體停下腳步。一些因子能解救卡住的核糖體,切碎受損的轉(zhuǎn)錄本。如果這些質(zhì)控因子出現(xiàn)故障,受損mRNA就會(huì)在細(xì)胞中累積,就像阿爾茨海默癥那樣。
意外的發(fā)現(xiàn)
DNA復(fù)制、mRNA轉(zhuǎn)錄和蛋白翻譯是三個(gè)基本的細(xì)胞程序,經(jīng)過(guò)數(shù)十億年的進(jìn)化,這些程序已經(jīng)非常準(zhǔn)確了。
為了研究翻譯的忠實(shí)性,Zaher等人決定為核糖體提供有問(wèn)題的mRNA轉(zhuǎn)錄本。他們將三聯(lián)體密碼中的G氧化成為8-oxo-G。“我們氧化這個(gè)堿基是因?yàn)?,?/span>DNA復(fù)制時(shí)被氧化的G會(huì)與A發(fā)生錯(cuò)配,”Zaher說(shuō)。
研究人員本以為核糖體會(huì)把C[8-oxo-G]C當(dāng)成CAC讀取,生成錯(cuò)誤的氨基酸鏈。然而,意外發(fā)生了。“核糖體并沒有犯錯(cuò),它只是停下來(lái)不處理有問(wèn)題的mRNA,”Simms說(shuō)。
No-go降解
隨后,研究人員構(gòu)建了300個(gè)核苷酸的mRNA探針,在植物和動(dòng)物細(xì)胞的提取物中進(jìn)行了測(cè)試。“我們可以根據(jù)核糖體合成的蛋白來(lái)判斷。蛋白長(zhǎng)度表明,核糖體在被氧化的堿基處停了下來(lái),”Simms介紹道。
一個(gè)mRNA上通常有幾個(gè)核糖體同時(shí)進(jìn)行翻譯。第一個(gè)核糖體停下后,其他核糖體就會(huì)被堵在它后面。結(jié)果這些核糖體就會(huì)生成一個(gè)蛋白ladder。
“問(wèn)題在于,細(xì)胞為核糖體花費(fèi)了大量的能量,需要收回這些卡住的核糖體,”Zaher說(shuō)。
細(xì)胞有三個(gè)解救核糖體的質(zhì)控體系,no-go降解就是其中之一。當(dāng)核糖體卡住不能前進(jìn)時(shí),一些因子就被招募過(guò)來(lái)打開核糖體,切碎mRNA并給有問(wèn)題的多肽打上降解標(biāo)記。研究人員發(fā)現(xiàn),被氧化的mRNA就是no-go降解的目標(biāo)之一。
不只是信使
酵母研究顯示,no-go降解拯救了卡住的核糖體之后,氧化mRNA就不會(huì)在細(xì)胞中累積。如果這個(gè)系統(tǒng)中釋放核糖體或降解mRNA的因子出現(xiàn)突變,那么細(xì)胞內(nèi)的氧化mRNA就會(huì)增多。
“mRNA翻譯體系是高度保守的,人體內(nèi)多半也存在這樣的機(jī)制,”Zaher說(shuō)。
被氧化的mRNA真的會(huì)引起疾病么?最近Science雜志上發(fā)表的一項(xiàng)研究顯示,翻譯系統(tǒng)存在雙重缺陷的小鼠,會(huì)患上嚴(yán)重的神經(jīng)退行性疾病。這種雙重缺陷包括,導(dǎo)致核糖體停止的t-RNA缺陷,以及核糖體停止后的解救缺陷。
“人們總是說(shuō),mRNA只不過(guò)是‘信使’,DNA和蛋白質(zhì)很關(guān)鍵,但mRNA更新得很快沒那么重要,”Simms說(shuō)。“但我們的研究顯示,mRNA也能造成很大的影響。”正因如此,細(xì)胞才演化出了三個(gè)獨(dú)立通路,確保受損mRNA不能在細(xì)胞中長(zhǎng)期逗留。