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PNAS:DNA錯(cuò)配修復(fù)蛋白如何運(yùn)作?

日期:2015-08-25 09:12:06

 最近,來自美國北卡羅來納州立大學(xué)(NC State)和北卡羅來納大學(xué)教堂山分校(UNC-Chapel Hill)的研究人員,解開了“在DNA復(fù)制過程中,兩個(gè)重要的DNA錯(cuò)配修復(fù)蛋白如何知道去哪里尋找錯(cuò)誤,以及它們?nèi)绾位ハ鄥f(xié)作,用信號通知身體的修復(fù)機(jī)制”。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在八月十七日的《PNAS》雜志。延伸閱讀:科學(xué)家解開DNA修復(fù)的謎團(tuán)。

 

當(dāng)一個(gè)細(xì)胞準(zhǔn)備分裂時(shí),DNA首先分裂,雙螺旋“解壓縮”成為兩個(gè)單獨(dú)的主干。新的核苷酸——腺嘌呤、胞嘧啶、鳥嘌呤或胸腺嘧啶,被填充到主干另一邊的缺口中,與它們的對應(yīng)物配對(腺嘌呤和胸腺嘧啶,鳥嘌呤和胞嘧啶),并為舊的和新的細(xì)胞復(fù)制DNA。大部分時(shí)間核苷酸是正確匹配的,但偶爾(在一百萬次中約有一次)會發(fā)生一次錯(cuò)配。

 

幸運(yùn)的是,我們的身體有一個(gè)檢測并修復(fù)這些錯(cuò)配的系統(tǒng)——一對蛋白質(zhì)稱為MutSMutL。在DNA復(fù)制后,MutS沿DNA鏈新建的一側(cè)滑動,并校對它。當(dāng)它找到一個(gè)錯(cuò)配時(shí),它鎖定到錯(cuò)配位點(diǎn),并招募MutL到來并結(jié)合它。MutL在新合成的DNA鏈中產(chǎn)生一個(gè)缺口,將其標(biāo)記為缺陷,并用信號通知不同的蛋白,吞噬包含錯(cuò)誤的那部分DNA。然后,核苷酸匹配重新開始填補(bǔ)空缺。整個(gè)過程可減少約一千倍的復(fù)制錯(cuò)誤,作為我們身體的最佳防御,防范基因突變及其可能導(dǎo)致的問題(如癌癥)。

 

本文共同作者、NC State物理學(xué)教授Keith Weninger指出:“每種生物都用這個(gè)過程用于DNA復(fù)制和修復(fù),我們知道組件是什么,但是有一些關(guān)鍵的機(jī)制,還不是很清楚。例如,當(dāng)DNA被修復(fù)時(shí),它只發(fā)生在DNA鏈的新部分,而不是舊的模板。為了擺脫有缺陷的部分,蛋白質(zhì)知道用哪種方式沿鏈移動。這里發(fā)生了溝通,但是關(guān)于它是如何運(yùn)作的,仍然存在爭議。”

 

科學(xué)家知道,一種名為PCNA的蛋白質(zhì),在這種溝通中起著重要的作用。PCNA位于DNA分裂的位點(diǎn),其在該位點(diǎn)上的物理定位表明了一段DNA鏈的哪一部分是新的。這被稱為鏈辨別信號MutLMutL以某種方式與這個(gè)信號相互作用,從而使MutL在鏈的適當(dāng)部位產(chǎn)生缺口,并表明需要修復(fù)??茖W(xué)家們對這種溝通提出了三種模型:MutSMutL蛋白結(jié)合形成一種夾鉗,滑向PCNA,并與信號相互作用,從而標(biāo)志著它們沿著滑動的區(qū)域需要?jiǎng)h除;或者它們在DNA上產(chǎn)生一個(gè)折疊,并將PCNA“拉向”它們,達(dá)到同樣的效果;或者MutL以某種方式覆蓋在缺陷區(qū),發(fā)信號修復(fù)。

 

Weninger,連同本文共同作者、來自UNC-Chapel HillDorothy Erie一起,想要確定最有可能的那種溝通方法。利用單分子熒光方法——可讓研究人員一次看到一個(gè)蛋白質(zhì)沿一段DNA片段移動,他們發(fā)現(xiàn),當(dāng)MutS找到一處錯(cuò)誤時(shí),它就會改變形狀,這種方式讓它與MutL結(jié)合,使它保持在錯(cuò)配的位點(diǎn)。然后,MutL改變其形狀,以“抓住”另一個(gè)MutL,以此類推,從而覆蓋一條鏈的有缺陷部分,并在需要修復(fù)的區(qū)域產(chǎn)生缺口。換句話說,Weninger、Erie和他們的同事們發(fā)現(xiàn),第三種模型是正確的。

 

Weninger說:“這個(gè)系統(tǒng),對于維持基因組的穩(wěn)定性,是必不可少的。我們知道所有的參與因子,以及這個(gè)過程的開始和結(jié)束,但這項(xiàng)工作填補(bǔ)了一個(gè)完全未知的中間步驟,非常不同于有些人想象的。”

 

他繼續(xù)說:“我們也知道,MutSMutL蛋白的突變,與非常特異性的癌癥有關(guān)。但是,如果我們想要弄清楚缺陷是如何導(dǎo)致疾病的,我們首先必須了解這些蛋白質(zhì)是如何正常工作的。這項(xiàng)研究朝向這一理解的又一步。”

 

特別關(guān)注