研究發(fā)現(xiàn)，越來越多的非編碼RNA（ncRNA）與各種人類疾病有關(guān)，包括癌癥，但是，肝細(xì)胞癌（HCC）的ncRNA轉(zhuǎn)錄組在很大程度上還是未知的。

最近，由日本理化學(xué)研究所（RIKEN）和法國國家健康與醫(yī)學(xué)研究院（INSERM）帶領(lǐng)的一個國際研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)，逆轉(zhuǎn)錄病毒長末端重復(fù)序列（LTR）啟動子——廣泛分布于人類基因組中的一種重復(fù)性元件，在肝細(xì)胞癌（肝癌最常見的類型）中是高度活化的。有趣的是，這些區(qū)域——在與病毒性肝炎相關(guān)的HCCs中被特別激活，在肝臟中通常是不被激活的，但在生殖組織（如睪丸和胎盤）中是被激活的。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在最近的《Genome Research》，表明LTR啟動子的激活，可能會導(dǎo)致肝癌的發(fā)展。延伸閱讀：權(quán)威期刊：阻止肝癌進(jìn)展的新方法。

逆轉(zhuǎn)錄病毒LTRs被廣泛認(rèn)為是逆轉(zhuǎn)錄病毒（如HIV病毒）的殘留物，它失去了退出細(xì)胞的能力，成為基因組中的寄生元件。RIKEN生命科學(xué)技術(shù)中心的Piero Carninci指出：“由于這些病毒元件包含的元件能夠發(fā)揮轉(zhuǎn)錄本那樣的功能，因此，生物體有時會為了自己的目的而使用這些LTRs，實(shí)際上它們在生殖組織中是高度活化的，如我們早期在ES和iPS細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的那樣。”

該研究團(tuán)隊(duì)采用CAGE技術(shù)——RIKEN開發(fā)的一種技術(shù)，來研究RNA在肝癌腫瘤與非腫瘤組織（取自同一患者）中的表達(dá)。他們發(fā)現(xiàn)，有4756個非編碼啟動子，相比較非腫瘤組織，它們在腫瘤組織中有更高的活性，值得注意的是，其中935個啟動子位于逆轉(zhuǎn)錄病毒的LTRs中。

然后，研究人員檢測了腫瘤的成因與侵襲性，他們發(fā)現(xiàn)，LTR啟動子的激活不僅與腫瘤的成因有關(guān)（其腫瘤與乙型肝炎、丙型肝炎和飲酒有關(guān)的患者，成因各有不同），也與腫瘤的進(jìn)展有關(guān)（低分化腫瘤復(fù)發(fā)的機(jī)會較高），有較高的水平表達(dá)。本文第一作者Kosuke Hashimoto說：“不同病因引發(fā)的腫瘤中存在不同的模式，這一事實(shí)表明，這些不僅僅是隨機(jī)激活，而且可能是腫瘤起源的一部分機(jī)制。”用HCC小鼠模型，他們還發(fā)現(xiàn)，18.9%的上調(diào)非編碼啟動子位于LTR元件中，而且這種表達(dá)在更晚期的腫瘤中更高?？磥?，我們在老鼠和人類看到了類似的現(xiàn)象。”

本研究團(tuán)隊(duì)計(jì)劃繼續(xù)開展研究，揭示各種LTR的功能，從而探討它們?nèi)绾螌?dǎo)致癌癥的發(fā)生。Carninci說：“我們希望，這項(xiàng)工作可以讓我們更好地了解肝癌的機(jī)理，并鑒定可用于診斷檢測的生物標(biāo)志物?？紤]到肝癌是世界上癌癥死亡的第二大原因，每年造成700000多人死亡，這項(xiàng)研究就顯得尤為重要。”