用CRISPR迅速鎖定致病突變
日期:2016-01-13 08:57:27
CRISPR/Cas技術(shù)可以實現(xiàn)定向基因組編輯,快速生成轉(zhuǎn)基因動物模型用于研究人類遺傳疾病。德國科學(xué)家們利用外顯子測序和CRISPR/Cas基因組編輯,在短時間內(nèi)鑒定了一種人類肢體缺陷的致病突變。這項成果發(fā)表在一月十一日的Genome Research雜志上。
細菌一直在與病毒或入侵核酸進行斗爭,為此它們演化出了多種防御機制,CRISPR/Cas適應(yīng)性免疫系統(tǒng)就是其中之一。規(guī)律成簇的間隔短回文重復(fù)CRISPR與內(nèi)切酶Cas9的組合,可以在引導(dǎo)RNA的指引下,靶標并切割入侵者的遺傳物質(zhì)。
2012年研究者們利用這一特點,將CRISPR系統(tǒng)發(fā)展成了強大的基因組編輯工具。該系統(tǒng)使用簡單而且擴展性強,很快便成為了生物學(xué)領(lǐng)域的香餑餑。幾乎所有實驗室都可以很方便的進行CRISPR基因組編輯,你只需要在自己感興趣的細胞或生物中表達Cas9內(nèi)切酶和引導(dǎo)RNA(gRNA)。內(nèi)切酶Cas9會在gRNA的指導(dǎo)下引入位點特異性的雙鏈斷裂,然后細胞通過同源重組進行修復(fù),最終改寫基因組的特定位點。最近,人們也開始用CRISPR-Cas9系統(tǒng)進行基因調(diào)控,隨心所欲的開/關(guān)基因。
研究人員在文章中描述的常染色體隱性疾病,發(fā)生在兩個不相關(guān)的家庭之中。這種疾病以裂足畸形(split-foot defect)、手指甲畸形和聽力損失為特征。研究人員發(fā)現(xiàn),發(fā)生這種疾病是因為突變干擾了蛋白激酶ZAK的SAM結(jié)構(gòu)域。
ZAK是MAPKKK家族的成員,此前人們并不知道它在四肢發(fā)育中起作用。研究顯示,小鼠發(fā)育中的四肢表達Zak,通過CRISPR/Cas敲除Zak會導(dǎo)致小鼠胚胎死亡。進一步研究表明,刪除SAM結(jié)構(gòu)域會誘導(dǎo)與Trp63下調(diào)有關(guān)的復(fù)雜后肢缺陷,而Trp63是裂手/裂足畸形的已知致病基因。
這項研究為人們揭示了ZAK在哺乳動物四肢發(fā)育中起到的關(guān)鍵性作用,還展示了CRISPR/Cas基因組編輯技術(shù)快速鑒定致病突變的強大能力。