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劉澎濤博士Nature:單細(xì)胞RNA-seq新成果

日期:2016-10-08 08:59:24

 929日,在國際頂級學(xué)術(shù)期刊《Nature》發(fā)表的一項研究中,來自英國威康信托基金會桑格研究所、香港中文大學(xué)、上海農(nóng)科院、上海交通大學(xué)、劍橋大學(xué)和墨爾本大學(xué)等處的研究人員,通過對骨髓(BM)先天淋巴細(xì)胞(ILCs)進(jìn)行單細(xì)胞RNA測序(scRNAseq),確定了不同的ILC前體細(xì)胞亞群,描述了不同的ILC發(fā)育階段和途徑,并發(fā)現(xiàn)PD-1可以作為先天淋巴祖細(xì)胞和效應(yīng)物ILCs的一個新型標(biāo)記。這提供了新的治療機(jī)會,來操縱ILCs實現(xiàn)最佳的免疫反應(yīng)。

 

英國威康信托基金會桑格研究所資深研究員劉澎濤(Pentao Liu)博士是這篇文章的資深作者。劉博士早年畢業(yè)于河南師范大學(xué),1998年博士畢業(yè)于美國貝勒醫(yī)學(xué)院,之后在馬里蘭州弗雷德里克國家癌癥研究所工作。2003年加盟英國威康信托基金會桑格研究所研究員,2010年晉升為資深研究員和課題組長,2011年起在劍橋大學(xué)干細(xì)胞研究所兼職。2005年至今擔(dān)任過包括輝瑞在內(nèi)多家生物醫(yī)藥公司之科學(xué)顧問,擅長化學(xué)基因組研究,先后發(fā)表學(xué)術(shù)論文70多篇。

 

20151月,劉澎濤博士帶領(lǐng)的一項新研究,確定了一個基因在侵襲性的乳腺癌亞型中尤其活躍。該研究表明,這一過度活化的BCL11A基因驅(qū)動了三陰性乳腺癌的形成和發(fā)展。相關(guān)論文發(fā)表在《自然通訊》(Nature Communications)雜志上。

 

20159月,在國際著名學(xué)術(shù)期刊《Genome Biology》發(fā)表的一項研究中,劉澎濤博士聯(lián)手劍橋大學(xué)、上海交通大學(xué)等處的研究人員,采用單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析來解析造血干細(xì)胞(HSCs)的分子異質(zhì)性。這項研究論證了單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄學(xué)用于解析干細(xì)胞區(qū)室中的細(xì)胞過程和譜系異構(gòu)性的效用。相關(guān)閱讀:劉澎濤博士:單細(xì)胞RNA-seq解析干細(xì)胞異質(zhì)性。

 

這項新研究指出,先天淋巴細(xì)胞(ILCs)在細(xì)胞毒性和細(xì)胞因子生產(chǎn)方面與T淋巴細(xì)胞功能相似,但缺乏抗原特異性受體,是免疫反應(yīng)和組織體內(nèi)平衡中重要的調(diào)節(jié)因子。ILC是由常見的淋巴系祖細(xì)胞(CLPs)生成的,它們后來定向分化為α淋巴祖細(xì)胞(αLP)中的先天淋巴細(xì)胞譜系、早期先天性淋巴祖細(xì)胞(EILP)、一般輔助型先天淋巴樣祖細(xì)胞(CHILP)和先天淋巴樣細(xì)胞祖細(xì)胞(ILCP)。ILCs由常規(guī)的NKcNK)和輔助樣細(xì)胞組成:ILC1、ILC2ILC3。盡管最近的進(jìn)展,細(xì)胞的異質(zhì)性、生長軌跡和ILC祖細(xì)胞的信號依賴性,仍然沒有得到全面的理解。

 

在這項研究中,研究人員通過對骨髓(BM)祖細(xì)胞進(jìn)行單細(xì)胞RNA測序(scRNAseq),來揭示先天淋巴細(xì)胞(ILCs)前體細(xì)胞亞群,描述不同的ILC發(fā)育階段和途徑,并發(fā)現(xiàn)程序性死亡1高表達(dá)(PD-1hi)標(biāo)志著一個基本上與ILCP相同的定向ILC祖細(xì)胞。這些數(shù)據(jù)將PD-1hiIL-25Rhi定義為ILC2發(fā)育中一個早期檢查點,可通過Bcl11b-缺陷抑制,但是可通過IL-25R過表達(dá)而得以恢復(fù)。類似于T淋巴細(xì)胞,PD-1在激活的ILCs上是上調(diào)的。施用PD-1抗體可減少PD-1hi ILCs,并減少感冒病毒感染模型中的細(xì)胞因子水平,并阻斷木瓜蛋白酶誘導(dǎo)的急性肺部炎癥。這些結(jié)果為探索免疫療法中的PD-1/PD-L1提供了新的視角,并使科學(xué)家能夠?qū)膊☆A(yù)防和治療的免疫系統(tǒng)進(jìn)行有效的操作。

 

特別關(guān)注