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何川教授新發(fā)Nature綜述:mRNA修飾介導(dǎo)的基因調(diào)控

日期:2016-11-08 08:46:15

 在分子生物學(xué)的中心法則中,遺傳信息從DNA、RNA流向蛋白。基因組DNA和組蛋白上都存在可逆的表觀遺傳學(xué)修飾,這些修飾可以調(diào)控基因的表達(dá),并由此決定細(xì)胞的狀態(tài),影響細(xì)胞的分化和發(fā)育。近年來人們發(fā)現(xiàn),mRNA和其他RNA上也存在類似的調(diào)控機(jī)制。

 

N6-methyladenosinem6A)是真核生物mRNA上最常見的一種轉(zhuǎn)錄后修飾,介導(dǎo)了超過80%RNA堿基甲基化。這種可逆的 mRNA甲基化修飾非常普遍,出現(xiàn)頻率大約是3-5個(gè)殘基/mRNAm6A的研究發(fā)現(xiàn)開辟了真核生物轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控的新領(lǐng)域。著名華人學(xué)者,芝加哥大學(xué)的何川(Chuan He)教授最近在Nature Reviews Molecular Cell Biology雜志上發(fā)表文章,探討了這種mRNA修飾介導(dǎo)的轉(zhuǎn)錄后基因調(diào)控。

 

何川教授主要從事化學(xué)生物學(xué)、核酸化學(xué)和生物學(xué)、遺傳學(xué)等方面的研究。近年來在甲基化修飾,尤其是5hmCm6A等方面獲得了許多重要的發(fā)現(xiàn)。迄今已在NatureScience等國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊發(fā)表了大量論文。曾榮獲美國(guó)癌癥研究青年科學(xué)家獎(jiǎng),凱克基金會(huì)醫(yī)學(xué)研究杰出青年學(xué)者獎(jiǎng)等多個(gè)獎(jiǎng)項(xiàng),并當(dāng)選為頂級(jí)生命醫(yī)學(xué)研究院HHMI研究員。

 

人們已經(jīng)鑒定了特異性識(shí)別m6A的蛋白,并對(duì)其進(jìn)行了功能分析。研究顯示,m6A是一種細(xì)胞加速mRNA代謝和翻譯的修飾。在細(xì)胞分化、胚胎發(fā)育和壓力應(yīng)答等過程中,m6AmRNA分組進(jìn)行加工、翻譯和衰變,進(jìn)而指引它們各自的命運(yùn)。何川教授還在文章中指出,m1AN1-methyladenosine)、m5C5-methylcytosine)、假尿嘧啶(pseudouridine)與m6A一同形成表觀轉(zhuǎn)錄組,編碼一個(gè)控制蛋白質(zhì)合成的新層面。

 

YTHDFm6A的讀取蛋白,YTHDF的結(jié)合會(huì)改變m6A RNA的翻譯效率和穩(wěn)定性。然而,人們還不了解YTHDF蛋白是如何造成m6A RNA降解的。中科院和復(fù)旦大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)八月二十五日在Nature Communications雜志上發(fā)表文章,揭示了YTHDF蛋白的作用機(jī)制。

 

m6A修飾與人類疾病關(guān)系密切,但科學(xué)家們對(duì)m6A起到的具體作用還知之甚少。約翰霍普金斯大學(xué)和中山大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),低氧條件通過m6A去甲基化誘導(dǎo)乳腺癌干細(xì)胞表型。這項(xiàng)研究發(fā)表在三月二十一日的美國(guó)國(guó)家科學(xué)院院刊PNAS雜志上。

 

目前的m6A分析方法主要是把methyl-RNA免疫沉淀和測(cè)序結(jié)合起來,稱為MeRIP-Seq或者m6A-Seq。這種方法只能將m6A殘基定位在100200 nt的轉(zhuǎn)錄本區(qū)域中,無法在全轉(zhuǎn)錄組水平上鑒定m6A的精確位置。去年六月美國(guó)康奈爾大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)在Nature Methods雜志上發(fā)表了一種名為miCLIP的新技術(shù)。這種技術(shù)可以很方便的獲得單核苷酸分辨率m6A圖譜。