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Science:追蹤蛋白單分子的復(fù)雜折疊網(wǎng)絡(luò)

日期:2011-11-02 08:44:51

近日來自德國(guó)慕尼黑工業(yè)大學(xué)(TUM)物理學(xué)家們通過新技術(shù)捕獲了單個(gè)蛋白質(zhì)分子的末端序列,并直接連續(xù)追蹤了這一蛋白分子去折疊和復(fù)折疊的完整過程,由此繪制出了從表達(dá)到降解整個(gè)過程中中間體結(jié)構(gòu)和動(dòng)力學(xué)狀態(tài)的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)圖譜。這一研究為科學(xué)家們解析生物細(xì)胞的生命過程開啟了一扇新窗口。相關(guān)研究成果發(fā)表在1028日的《科學(xué)》(Science)雜志上。

 

領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是德國(guó)慕尼黑工業(yè)大學(xué)生物物理系主任Matthias Rief博士,這位年輕的生物物理學(xué)家在物理學(xué)和生物學(xué)的跨學(xué)科領(lǐng)域取得不少重要成果,為生物學(xué)研究提供了一些重要的新工具,研究論文多次發(fā)表在Science雜志上。

 

蛋白質(zhì)是一種結(jié)構(gòu)復(fù)雜但極其重要的一種生物大分子,其功能很大程度上取決于它們的結(jié)構(gòu)。對(duì)于蛋白分析的一種重要方面就是解析蛋白折疊過程,這個(gè)過程是一個(gè)多相過程,從展開態(tài)到折疊態(tài)發(fā)生一系列復(fù)雜的微觀過程,深入了解這一折疊機(jī)理,對(duì)于保留蛋白質(zhì)活性,維持蛋白質(zhì)穩(wěn)定性和包涵體蛋白質(zhì)折疊復(fù)性都具有重要的意義,因此蛋白折疊問題被列為“21世紀(jì)的生物物理學(xué)”的重要課題。

 

多年來研究人員們一直致力探索多種途徑了解它們的折疊(或去折疊)機(jī)制。X-射線結(jié)構(gòu)分析法為研究者們提供了蛋白質(zhì)折疊的“快照”,卻無法獲得完整的動(dòng)態(tài)過程,Rief此前開發(fā)了一種稱之為原子力顯微鏡單分子力譜的新工具,可用于單分子水平研究分子內(nèi)與分子間的相互作用,揭示超分子結(jié)構(gòu)的本質(zhì)和動(dòng)態(tài)過程。然而由于這一技術(shù)僅能獲得分子的長(zhǎng)度數(shù)據(jù),因而產(chǎn)生的動(dòng)態(tài)影像非常的模糊。在新研究中,Rief與同事開發(fā)出了一種超穩(wěn)定-高分辨率的“光學(xué)鑷子”,利用這一工具他們可捕獲到反向激光束間的微小物體。

 

鈣調(diào)蛋白是由148個(gè)氨基酸殘基組成的單鏈蛋白質(zhì),能夠與鈣結(jié)合在細(xì)胞內(nèi)具有促進(jìn)信息傳遞的功能,對(duì)細(xì)胞的生長(zhǎng)和發(fā)育具有重要的作用。在這篇文章中,研究人員利用“光學(xué)鑷子”結(jié)合單分子力譜,捕獲并追蹤了單個(gè)鈣調(diào)蛋白分子從折疊狀態(tài)到去折疊,然后再?gòu)?fù)折疊的整個(gè)過程,連續(xù)測(cè)量了蛋白質(zhì)長(zhǎng)度、機(jī)械力和精確時(shí)間的等數(shù)據(jù),繪制了不同折疊狀態(tài)下中間體的結(jié)構(gòu)及動(dòng)力學(xué)狀態(tài),以及復(fù)雜的信號(hào)網(wǎng)絡(luò)。

 

 “盡管鈣調(diào)蛋白分子相對(duì)于人體中的大多數(shù)蛋白而言是一種小分子蛋白,其折疊仍顯示了出人意料的復(fù)雜性,”Rief說:“大自然能夠使得更為復(fù)雜的蛋白質(zhì)發(fā)生折疊而不出現(xiàn)錯(cuò)誤,了解這一過程在未來仍是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。單分子實(shí)驗(yàn)或許能為解析這一問題提供一些幫助。”