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華裔NIH創(chuàng)新獎得主Nature獲單細(xì)胞技術(shù)突破

日期:2012-06-25 08:05:07

來自加州理工學(xué)院的研究人員發(fā)表了題為“Single-cell systems biology by super-resolution imaging and combinatorial labeling”的文章,采用了一種簡單有效的技術(shù)策略,解決了熒光顯微技術(shù)中,無法同時觀察多種分子種類的問題,讓系統(tǒng)生物學(xué)進(jìn)入單細(xì)胞時代!這一研究成果公布在Nature Methods雜志上。

 

領(lǐng)導(dǎo)這一研究的是加州理工學(xué)院華裔科學(xué)家蔡龍(Long Cai),蔡博士畢業(yè)于哈佛學(xué)院,去年曾榮獲美國衛(wèi)生研究院“創(chuàng)新獎”。

 

Nature Methods評出的幾年的值得關(guān)注技術(shù)中,單細(xì)胞技術(shù)都榜上有名,這是一種相對于群體細(xì)胞研究,針對單個細(xì)胞的研究技術(shù)。由于培養(yǎng)基或者機(jī)體中的細(xì)胞存在多樣性,或者說是異質(zhì)性,這為許多實(shí)驗分析造成了障礙??梢哉f,隨著現(xiàn)代生物學(xué)的發(fā)展,“平均值”這個詞已經(jīng)不能滿足我們的需要了,我們要了解細(xì)胞之間的差異性。

 

然而要進(jìn)行單細(xì)胞分析也困難重重,從技術(shù)上說也存在幾個方面的問題。首先無論是針對一個特異性大分子,還是在OMIC水平上進(jìn)行分子分析,都存在單細(xì)胞提取物數(shù)量少,難以分析的困難,這甚至可以說是不可能完成的,因此增加靈敏度勢在必行。除此之外高通量分析也是一個瓶頸,要想獲得單細(xì)胞分析確切的分析結(jié)果,研究人員必須快速而準(zhǔn)確的分析多個細(xì)胞,這并不容易。

 

傳統(tǒng)的熒光顯微技術(shù)在探索單細(xì)胞調(diào)控網(wǎng)絡(luò)方面,是一個有力的工具,但是這種技術(shù)熒光基團(tuán)光譜的重疊,限制了同時觀察分子種類的數(shù)量。由此在這篇文章中,研究人員采用了一種簡單,但是有效的技術(shù)策略,解決了這個問題。

 

這種方法利用了超高分辨率顯微技術(shù),并結(jié)合分子標(biāo)記,極大的提高了單細(xì)胞中多重分子檢測能力。近年來,超分辨率顯微鏡領(lǐng)域取得了大量的成果,空間分辨率不斷提高,這些技術(shù)大大提高科學(xué)家們獲得單細(xì)胞結(jié)構(gòu)清晰圖譜的能力。

 

研究人員利用熒光原位雜交FISH制成一種獨(dú)特的熒光基團(tuán)組合,用以標(biāo)記mRNAs,解決了測序,和SRM熒光基團(tuán)結(jié)合問題。通過實(shí)驗,他們同時在單個釀酒酵母細(xì)胞中,同時分析了32個基因的mRNA表達(dá)水平。

 

這項研究證明結(jié)合標(biāo)記,和超高分辨率成像技術(shù),將能簡單有效的讓系統(tǒng)生物學(xué)進(jìn)入單細(xì)胞時代。

 

同時Nature Methos雜志還公布了另外一項超高分辨率顯微單細(xì)胞研究成果,研究人員利用超分辨率顯微鏡解析了相比過去能看到的小一個數(shù)量級的細(xì)胞元件。這使得研究人員能夠挖掘到從前無法觸及的信息,解答新的生物學(xué)問題。

 

研究人員提出了一種基于全局優(yōu)化的新方法,采用壓縮傳感,無需估計和推斷成像中的分子數(shù)量。他們證實(shí)相比于其他的技術(shù),壓縮傳感能夠兼容更高的分子密度,以三秒的時間分辨率顯示活細(xì)胞熒光蛋白標(biāo)記微管成像。他們利用STORM對黑腹果蠅S2細(xì)胞中免疫熒光染色的微管成像,利用少至100個照相機(jī)像幀通過壓縮傳感解析了鄰近微管,而單分子擬合方法則無法辨別這些結(jié)構(gòu)。他們對穩(wěn)定表達(dá)融合mEos2tubulinS2細(xì)胞進(jìn)行了活細(xì)胞STROM觀測。

 

特別關(guān)注