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Your Good Partner in Biology Research

Nature子刊突破性研究:破譯膠原的密碼

日期:2012-09-27 08:08:41

膠原是連接細胞形成組織和器官的纖維狀蛋白,人體是生產(chǎn)膠原的專家,而科學家們也一直希望能在實驗室中合成這一物質。美國Rice大學的研究人員在膠原合成領域取得了重大突破,將有望幫助人們進行新藥設計和研發(fā)。Rice大學的科學家們在成功合成膠原之后,展開了深入研究來分析膠原的結構和形成及其與生物系統(tǒng)之間的相互作用。

 

Rice大學的化學和生物工程學副教授Jeffrey Hartgerink及其學生Jorge Fallas開發(fā)了一個新計算機程序,能夠預測納米級膠原的最穩(wěn)定結構。在自然界中,正是這些微小的膠原結構結合成鏈組成了機體的結締組織。HartgerinkFallas根據(jù)他們的軟件合成并測試了大量膠原。

 

他們的這項突破性成果于九月二十五日提前發(fā)表在Nature Communications雜志的網(wǎng)站上,這無疑會引起重建外科、化妝品和組織工程等領域研究者們的極大興趣,同時也有助于人們探尋膠原蛋白的相互作用,為癌癥及其他疾病尋求新的治療方式。

 

“膠原是人體中豐度最高的蛋白,”Hartgerink說,他發(fā)現(xiàn)了自組裝膠原的新合成方法?!斑@種連接性纖維的基本功能是將細胞聯(lián)系在一起?!薄皬暮可蟻碚f,膠原是人體內最普遍的蛋白。但它與你所見到的其他蛋白都不一樣,”他說。

 

Hartgerink將膠原的結構與DNA雙螺旋進行了類比,“WatsonCrick在研究DNA時,發(fā)現(xiàn)了這些堿基對結合在一起的方式,”他說?!澳z原的結構與DNA有些相似,只不過膠原由三條肽鏈組成。我們的這項研究就是旨在揭示氨基酸相互結合形成穩(wěn)定結構的機制。”

 

對膠原結構感興趣的科學家并不多,近來人們確定了越來越多的蛋白結構,但膠原蛋白的結構研究卻落在了后面。實際上,膠原的特性使其能夠成為頗有價值的生物支架原料,人們能夠應用這樣的生物支架來生產(chǎn)組織甚至整個器官用于醫(yī)療。“膠原所做的并不僅僅是將細胞聯(lián)系在一起,”Hartgerink說?!八材軌蚺c其他蛋白結合,承擔特殊的功能。在這些蛋白與膠原結合后,細胞再與上述蛋白結合,在相互作用的基礎上決定自身行為或者分化為另一種細胞類型。”

 

膠原蛋白的三條鏈必須要合理配置才能夠具有功能,在這項新研究中HartgerinkFallas著眼于帶正負電荷的氨基酸之間的相互作用,分析怎樣的氨基酸排列才能使三條肽鏈形成三螺旋。

 

肽鏈結合的方式還決定了膠原螺旋的穩(wěn)定性,Hartgerink說。FallasHartgerink設計的計算機程序能夠計算肽鏈結合的穩(wěn)定性,在本研究中他們對27條肽鏈進行了排列組合,來尋找最佳的配對方式。改程序會基于整個螺旋所帶的電荷給每種組合評分。他們已經(jīng)將程序的源代碼放在自己研究團隊的主頁上,共其他研究者嘗試。

 

這項新成果還有望幫助人們破解膠原在癌轉移中起到的作用。“癌細胞需要降解膠原才能從一個器官轉移到另一個器官。要分析癌細胞是怎樣做到這一點的,我們就得先了解膠原的結構,”Hargerink說。