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Nature重大成果:豬基因組全面解析

日期:2012-11-15 08:37:46

豬(pig)及其表親野豬(wild boar)與人類具有許多共同之處。它們遍及世界各地。它們的適應(yīng)能力強,具有入侵性,常常毀壞自己的棲息地。它們易受食物引誘,容易馴化,但當條件允許時它們會恢復(fù)野生生活方式。

 

現(xiàn)在一項新的基因組分析揭示了豬和人類之間一些新的、意想不到的、潛在有利的相似之處,以及一些明顯的差異。由伊利諾大學(xué)、荷蘭瓦格寧根大學(xué)和愛丁堡大學(xué)的研究人員領(lǐng)導(dǎo)的國際豬基因組測序聯(lián)盟(International Swine Genome Sequencing Consortium)完成了這一分析。這是對于家豬和野豬開展的最為全面的一次基因組研究。

 

這一研究被選為封面文章,發(fā)表在1115日的《自然》(Nature)雜志上。

 

美國農(nóng)業(yè)部豬基因組測序計劃的早期支持者、內(nèi)布拉斯加大學(xué)副校長Ronnie Green 說:“令人興奮的是現(xiàn)在這些家豬的基因組序列可通過公共域免費獲得,以促使將更強有力的方法運用到家豬飼養(yǎng)和豬肉改善。它還將推動豬作為生物醫(yī)學(xué)研究的模型,改善人類的健康?!?/SPAN>

 

美國農(nóng)業(yè)部國家食品與農(nóng)業(yè)研究所主任Sonny Ramaswany 說:“這一新分析有助于我們了解遺傳機制推動生產(chǎn)優(yōu)質(zhì)豬肉、提高飼養(yǎng)效率和抗病能力。這方面的知識最終能夠幫助生產(chǎn)者飼養(yǎng)高品質(zhì)的豬,降低生產(chǎn)成本,促進可持續(xù)性發(fā)展?!?/SPAN>

 

研究人員將一種常見農(nóng)場豬Susscrofa domesticus10種野豬的基因組進行了比較。所有這些動物來自歐洲和亞洲的不同地區(qū)。他們還將豬的基因組與人類、小鼠、狗、馬和牛的基因組進行了比較。

 

研究小組發(fā)現(xiàn)了成為家豬祖先后Sus scrofa進化的一些新細節(jié),其與現(xiàn)在的野豬非常的相似,首先出現(xiàn)于南亞,后逐漸遷移跨越亞歐大陸。

 

研究的課題領(lǐng)頭人、伊利諾大學(xué)副校長Lawrence Schook說比較亞洲和歐洲野豬揭示出顯著的遺傳差異,結(jié)果表明它們彼此分離大約是在100萬年前。

 

Schook說:“它們分離如此之久以至于亞洲和歐洲譜系現(xiàn)在幾乎都已經(jīng)是亞種?!贝蠹s在2萬年前,歐洲和亞洲的野豬喪失了大量的遺傳多樣性,有可能是由于全球冰川事件的結(jié)果。

 

將家豬與野豬進行比較也“揭示出歐洲品種與亞洲品種之間明顯的差異,”研究人員寫到。這增加了證據(jù)表明“歐亞大陸西部和東亞的豬是獨立馴化的?!?/SPAN>

 

研究的課題領(lǐng)頭人、華盛頓大學(xué)教授Martien Groenen 說:“我們有來自以往研究的一些證據(jù),但這種研究主要將焦點放在線粒體DNA(一種遺傳自母親的小DNA分子)上。擁有多個野豬的完整基因組序列,我們現(xiàn)在更加清楚地了解了這些事件?!?/SPAN>

 

“為了能夠更有效地飼養(yǎng)豬來滿足日益增長的需求,并抵御舊的和新出現(xiàn)的疾病,了解現(xiàn)代豬的遺傳起源非常重要,”研究的課題領(lǐng)頭人、愛丁堡大學(xué) Roslin研究所教授Alan Archibald說。

 

研究人員報告說在家豬中一些基因家族經(jīng)歷了相對快速的進化,有一些免疫基因和嗅覺基因迅速擴增。這或許并不令人感到驚訝,相比于人類、小鼠或狗,豬有著獨特的嗅覺基因。

 

盡管豬能夠聞到人類和許多其他動物無法聞到的許多東西,但它們的味覺在一定程度上受到損害。

 

“豬能夠高度耐受包含大量鹽的食物,或是我們的味覺排斥的東西,” Schook說。

 

研究人員發(fā)現(xiàn)相比人類,豬的苦味受體基因顯著減少,此外豬和人類感知甜味和鮮味(umami)的基因也有不同。

 

Archibald 說:“了解這些形成構(gòu)成豬特征的基因可以揭示人類是如何馴化這些豬的,以及它們能夠被馴化的原因。或許能夠吃下我們?nèi)祟悷o法接受的東西是它們的能力?!?/SPAN>

 

新分析還支持將豬用于研究人類疾病。

 

研究人員寫到:“總體上,我們發(fā)現(xiàn)了112個位點上的豬蛋白具有與人類疾病相關(guān)的相同氨基酸?!?/SPAN>

 

通過測序另外的48頭豬,“我們鑒別了與人類疾病相關(guān)的更多的遺傳變異,進一步地支持豬作為一種有價值的生物醫(yī)學(xué)模型,” Groenen說。

 

豬與人類共同擁有一些與肥胖、糖尿病、閱讀障礙(dyslexia)、帕金森氏病和阿爾茨海默氏癥相關(guān)的蛋白質(zhì)變異。

 

研究人員說新分析對于農(nóng)業(yè)具有重要的意義,尤其是因為家豬仍有一種祖先樣的野豬表親。不同于馴養(yǎng)的牛,它的祖先歐洲野牛(aurochs)現(xiàn)在已經(jīng)滅絕,豬譜系仍然有大量的遺傳多樣性。

 

“我們可以輕易的找到有可能仍然存在于自然界中的基因,現(xiàn)在我們可利用它們來到達飼養(yǎng)目的,” Schook說。

 

伊利諾大學(xué)校長Bob Easter說:“這項研究證實了基礎(chǔ)基因組研究對于農(nóng)業(yè)動物和它們的現(xiàn)存近親的益處。這一工作對于農(nóng)業(yè)具有重要的意義,推動我們了解了進化,將有助于人類醫(yī)學(xué)?!?/SPAN>

 

特別關(guān)注