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研究人員提出小核糖體RNA新概念

日期:2013-02-26 09:10:10

中科院上海生科院營(yíng)養(yǎng)科學(xué)研究所翟琦巍研究組在一項(xiàng)研究中,提出了小核糖體RNA srRNA)這一新概念,并初步發(fā)現(xiàn)srRNA和糖尿病存在相關(guān)性并具有生物學(xué)功能。相關(guān)成果近日在線發(fā)表在美國(guó)《公共科學(xué)圖書館—綜合》(PLOS ONE)雜志上。

 

據(jù)介紹,近年來,小RNA的研究發(fā)展迅猛,各種類型的小RNA相繼被發(fā)現(xiàn)和鑒定。在小RNA高通量測(cè)序數(shù)據(jù)中,經(jīng)常會(huì)發(fā)現(xiàn)存在相當(dāng)數(shù)量的、和核糖體DNA 完全匹配的小RNA。但在常規(guī)的數(shù)據(jù)分析過程中,這些小RNA會(huì)被當(dāng)做是降解的核糖體RNA 而直接舍棄。

 

翟琦巍團(tuán)隊(duì)分析發(fā)現(xiàn),小鼠miR-696等已經(jīng)鑒定的10miRNA序列和rDNA完全匹配,并且小鼠piR-16等已經(jīng)鑒定的60piRNA序列也和rDNA完全匹配。這些都提示,和rDNA完全匹配的微小RNA很可能是一類具有生物學(xué)功能的非編碼小RNA。

 

該團(tuán)隊(duì)博士后衛(wèi)海濱、博士生周犇等在對(duì)小RNA高通量測(cè)序數(shù)據(jù)分析時(shí)發(fā)現(xiàn),測(cè)序數(shù)據(jù)中存在相當(dāng)數(shù)量的和已有的人、小鼠等哺乳動(dòng)物基因組不能匹配的小RNA。深入研究發(fā)現(xiàn),由于目前的人、小鼠等哺乳動(dòng)物的基因組數(shù)據(jù)中不包含rDNA重復(fù)單元,這些小RNA中相當(dāng)一部分可以和rDNA完全匹配。進(jìn)一步的小鼠糖尿病模型研究發(fā)現(xiàn),srRNA的表達(dá)譜和糖尿病存在相關(guān)性。利用細(xì)胞模型的初步研究還發(fā)現(xiàn),srRNA具有生物學(xué)功能。

 

該研究團(tuán)隊(duì)認(rèn)為,srRNA的存在并具有生物學(xué)功能是有其合理性的。研究提示,srRNA至少并不完全是隨機(jī)降解的產(chǎn)物。同時(shí),srRNA可以特異性地和AGO蛋白結(jié)合,提示其可能和miRNA等一樣具有生物學(xué)功能??茖W(xué)家表示,目前已知的很多小RNA是與rDNA完全匹配的,也就是說,這些已知的小RNA就是srRNA。

 

有關(guān)專家認(rèn)為,srRNA這一新概念的提出,一方面會(huì)加深對(duì)于小RNA的理解,另一方面會(huì)引起研究人員對(duì)于srRNA在不同生理病理過程中的作用和機(jī)制的重視,為糖尿病等疾病的診斷和治療提供新思路。